最早的RNA-seq，把一大群细胞混在一起，抽出RNA一起测序。由于所使用的管子枪头等器材容易粘附RNA，实...
RNA-seq的应用和进步是由技术发展(湿实验室和计算生物学)驱动的,相对于以前的基因芯片,RNA-seq这种方法对RNA生物学和转录组产生更丰富并且偏见更小的信息。到目前为止,从标准的RNA-seq方法衍生而来的各种RNA-seq方法几乎有100种。Illumina的短读长(short-read)测序平台能对这些由大部分不同方法的RNA-seq构建的文库...
RNA-seq的应用展望: ①非bulk RNA-seq RNA-seq还是站在整个组织或者细胞群体的角度来解答生物学问题,但是进一步探究必然会涉及到特定的细胞类型和空间信息的保留,因此进一步诞生了单细胞转录组(scRNA-seq)和空间转录组。其中scRNA-seq已经在推动大规模的细胞图谱项目,并且也已经有了越来越广泛的应用范围。ScRNA-seq已...
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...
在过去的十几年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在转录组层面分析差异基因表达(DEG)和mRNA差异剪接的必备工具。时代和技术的进步下,RNA-seq也在进一步发展,基于更新的技术,RNA-seq可以在单细胞、翻译、空间等方向都有进一步的应用。与长读长技术的结合创新更是有助于更全面地了解RNA和转录乃至调控过程。
1.技术优化和创新:随着单细胞测序技术的不断发展,研究人员正在努力提高其通量、灵敏度和准确性。例如,北京大学汤富酬教授与文路副研究员开发的基于第三代测序平台的单细胞RNA-seq技术,通过提高数据处理的高通量和高灵敏度,为全长转录本的检测提供了新的工具。
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
1、RNA-seq技术简介2、RNA-seq技术原理3、RNA-seq成果分析4、RNA-seq技术应用 1.诞生于20世纪70年代旳Sanger法是最早被广泛应用旳DNA测序技术，也是完毕人类基因组计划旳基础。2.2023年以来，以Roche企业旳454技术、Illumina企业旳Solexa技术和ABI企业旳SOLiD技术为标志旳新一代测序技术相继诞生，又称作深度测序技术。
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...