一、单细胞RNA-seq扩增技术的发展 利用单细胞进行 RNA-seq 是 Surani 实验室在 2009 年开发出来的,扩增的方法主要是使用将RNA pull down下来,然后使用polyT 引物反转录带 ployA 的 RNA,同时引物上含有特定的 anchor 序列。 研究人员借鉴了基于 microarray 用于 single cell sequence 的技术后,修改了一些实验条件(...
RNA-Seq广泛应用于AD的发病机制研究,尤其是相关免疫和炎症通路,如Th1、Th2、Th17、Th22细胞极化过程的转录组与AD疾病进展关系密切。为梳理AD发病机制的分子因素,以“特应性皮炎”、“Atopic Dermatitis”、“分子”、“基因”、“转录组”和“RNA-Seq”等为关键词检索文献,发现AD致病基因大致分为三类(表1),包括...
在被问及单细胞RNA-Seq的主要应用时,Bio-Rad的高级产品经理Dan Norton指出:“尽管它的应用领域非常广泛,但免疫学一直是一个巨大的推动力。这主要是因为,相对于实体组织的原代细胞而言,免疫细胞更容易获得和分析。从自身免疫性疾病到免疫肿瘤学,研究人员正在研究免疫系统自身的疾病,以及如何利用免疫系统来对付其他疾病。
RNA-seq至今已有近二十年的发展，为我们认知基因组功能助力巨大。RNA-seq最常用于寻找差异基因（DEG），也是如今最广泛的分析DEG的工具方法。同时RNA-seq的广泛应用极大地丰富了我们对于生物学方面的理解，如mRNA的可变剪接、ceRNA的网络等，给我们以前所未有的角度去理解RNA的生物学功能。但是RNA-seq技术大多还是基于...
在过去的十几年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在转录组层面分析差异基因表达(DEG)和mRNA差异剪接的必备工具。时代和技术的进步下,RNA-seq也在进一步发展,基于更新的技术,RNA-seq可以在单细胞、翻译、空间等方向都有进一步的应用。与长读长技术的结合创新更是有助于更全面地了解RNA和转录乃至调控过程。
RNA-seq,即通过高通量测序技术进行的转录组测序分析技术。最初作为研究mRNA,small RNA,non-coding RNA 等表达水平、表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今, RNA-seq 在转录本变异、基因融合、可变剪切检测等场景均有大规模的应用。靶向 RNA-seq 则是对特定的转录本进行重点分析,与标准RNA-seq 类似...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
1. 单细胞RNA-seq技术 随着研究人员对单细胞水平的兴趣增强,单细胞RNA-seq技术成为了当前的研究热点。 2. 均衡测序技术的发展 研究人员持续改进RNA-seq技术,提高其覆盖面和准确性,以适应对转录组学的更高要求。 六、结语 本文从RNA-seq的原理、优势、应用以及未来趋势等方面对RNA-seq技术进行了梳理和阐述。随着...
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...