RNA测序(RNA-seq)是一种用于研究转录组的工具,转录组是存在于一个或一组细胞中的总RNA分子,包括蛋白质编码RNA(mRNA)和调节或非编码RNA(miRNA、tRNA等)。 2.RNA-Seq有什么用? 1)检测并定量样品的转录组水平 2)检测RNA alternative splicing 3)检测transcript isoform 4)检测gene mutation 3.RNA-Seq实验的基本...
关于RNA-seq的简单介绍 RNA-seq是一款可用于研究和/或定量两个或多个条件下基因表达的实验技术。 众所周知,基因可以给蛋白质的合成提供指导,而蛋白质会在细胞中发挥一定的作用。尽管所有的细胞都包含… 阅读全文 登录知乎,您可以享受以下权益: 更懂你的优质内容 ...
通常,核糖体RNA代表细胞中存在的大部分RNA,而mRNA(信使RNA)代表一小部分,在人类中约为 2%。因此,如果我们想要研究蛋白编码基因,就必须富集mRNA或 去除rRNA。对于差异基因表达分析,最好对Poly(A)+进行富集,除非目标是获取有关长链非编码RNA的信息,在这种情况下建议去除核糖体RNA。 RNA质量检查 在开始cDNA文库制备之...
介绍RNAseq, 视频播放量 1824、弹幕量 0、点赞数 33、投硬币枚数 11、收藏人数 101、转发人数 19, 视频作者 小云爱生信, 作者简介 我司将持续更新生物信息学,相关视频,文章,关注可私信提问哦!,相关视频:
通常,RNA-seq用于由混合细胞组成的样本,称为Bulk RNA-seq,具有多种应用。例如,它可用于表征健康/患病、野生型/突变型或对照/处理样本中组织之间的表达特征,或者在进化研究中,使用不同物种的组织样本的比较转录组学。除了用于转录本定量之外,它还可用于在模式和非模式物种中查找和注释新基因、基因异构体和其他转录本...
RNA-Seq定量分析介绍
27:53 RNA-seq整体分析流程介绍 33:38 fastq数据介绍及具体质控结果查看 41:43 Count数据介绍 43:48 样本相似性分析:相关分析及PCA 50:13 Deseq2差异表达分析 57:37 差异结果解读以可视化解读 已关注关注重播分享赞关闭观看更多更多正在加载正在加载退出全屏切换到竖屏全屏退出全屏...
RNA-Seq数据,在这里指的是基于NGS测序技术,在转录组水平对样本中基因表达进行定量,得到的counts数据,比如HTseq,hisat2,RSEM等上游定量分析软件得到的counts矩阵。 得到样本基因表达数据后,我们通常会对不同样本分组,然后进行差异表达分析,将基因表达变化与表型联系起来,解释与表型...