最早的RNA-seq，把一大群细胞混在一起，抽出RNA一起测序。由于所使用的管子枪头等器材容易粘附RNA，实...
一、单细胞RNA-seq扩增技术的发展 利用单细胞进行 RNA-seq 是 Surani 实验室在 2009 年开发出来的,扩增的方法主要是使用将RNA pull down下来,然后使用polyT 引物反转录带 ployA 的 RNA,同时引物上含有特定的 anchor 序列。 研究人员借鉴了基于microarray用于 single cell sequence 的技术后,修改了一些实验条件(比如...
RNA-seq的应用和进步是由技术发展(湿实验室和计算生物学)驱动的,相对于以前的基因芯片,RNA-seq这种方法对RNA生物学和转录组产生更丰富并且偏见更小的信息。到目前为止,从标准的RNA-seq方法衍生而来的各种RNA-seq方法几乎有100种。Illumina的短读长(short-read)测序平台能对这些由大部分不同方法的RNA-seq构建的文库...
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...
1.技术优化和创新:随着单细胞测序技术的不断发展,研究人员正在努力提高其通量、灵敏度和准确性。例如,北京大学汤富酬教授与文路副研究员开发的基于第三代测序平台的单细胞RNA-seq技术,通过提高数据处理的高通量和高灵敏度,为全长转录本的检测提供了新的工具。
在过去的十几年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在转录组层面分析差异基因表达(DEG)和mRNA差异剪接的必备工具。时代和技术的进步下,RNA-seq也在进一步发展,基于更新的技术,RNA-seq可以在单细胞、翻译、空间等方向都有进一步的应用。与长读长技术的结合创新更是有助于更全面地了解RNA和转录乃至调控过程。
其中,随着转录组学的流行,miRNA、lncRNA和circRNA等非编码RNA的爆红,转录组测序技术(RNA-seq)的发展速度也一路水涨船高、势如破竹。 而技术的进步和成本降低也使得RNA-seq这种高大上的技术,已经逐渐走下“神坛”、站在了潮流的最前线了。 一般而言,如果要做二代测序,不分析点剪接异构、功能调控、新转录本发现...
1. 单细胞RNA-seq技术 随着研究人员对单细胞水平的兴趣增强,单细胞RNA-seq技术成为了当前的研究热点。 2. 均衡测序技术的发展 研究人员持续改进RNA-seq技术,提高其覆盖面和准确性,以适应对转录组学的更高要求。 六、结语 本文从RNA-seq的原理、优势、应用以及未来趋势等方面对RNA-seq技术进行了梳理和阐述。随着...
RNA-seq,即通过高通量测序技术进行的转录组测序分析技术。最初作为研究mRNA,small RNA,non-coding RNA 等表达水平、表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今, RNA-seq 在转录本变异、基因融合、可变剪切检测等场景均有大规模的应用。靶向 RNA-seq 则是对特定的转录本进行重点分析,与标准RNA-seq 类似...