1.RNA-seq的测序误差主要由生物学误差(生物学重复,比如取30只小鼠采样)和技术性误差(技术性重复,比如对1只小鼠采样3次)造成,如果想要得到的数据为无偏的,那么生物学重复最重要,因为生物个体代表着样本,而技术手段只会造成不可控干扰。总的来说,只做技术性重复的实验结果偏差最大,技术性重复+生物学重复的实验结果...
最早的RNA-seq，把一大群细胞混在一起，抽出RNA一起测序。由于所使用的管子枪头等器材容易粘附RNA，实...
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...
1、RNA-seq技术简介2、RNA-seq技术原理3、RNA-seq结果分析4.RNA-seq技术应用 精选2021版课件 2 一、RNA-seq技术简介 1.诞生于20世纪70年代的Sanger法是最早被广泛应用的DNA测序技术,也是完成人类基因组计划的基础。2.2005年以来,以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的新一代...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
第三课 RNAseq发展历史 RNAseq主要获得基因的表达水平 分子杂交 RT-PCR(需要预先知道序列信息才能采用该方法) EST表达序列标签(只能得到部分转录本信息,而得不到全部的转录本信息) 基因表达的连续分析技术SAGE 芯片技术Microarray(只能检测已知的序列,且不容易定量) ...
1、RNA-seq技术简介2、RNA-seq技术原理3、RNA-seq结果分析4、RNA-seq技术应用 一、RNA-seq技术简介 1.诞生于20世纪70年代的Sanger法是最早被广泛应用的DNA测序技术，也是完成人类基因组计划的基础。2.2005年以来，以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的新一代测序技术相继诞生...