目前最为流行的 RNA-Seq 数据比对软件是 HISAT2 和 STAR,它们可以说是大浪淘沙后的优胜者。特别值得一提的是,STAR 的升级版 STARsolo 在单细胞测序数据的比对和质控方面得到了越来越广泛的应用,感兴趣的小伙伴可以参考论文:STARsolo: accurate, fast and versatile mapping/quantification of single-cell and singl...
当前，RNA-Seq数据比对领域最为流行的软件无疑是HISAT2和STAR，这两者经过激烈竞争，脱颖而出，成为了行业的佼佼者。尤其值得一提的是，STAR的最新版本STARsolo在单细胞测序数据的比对与质量控制方面展现了广泛的应用潜力。对此感兴趣的朋友们，不妨深入了解一下其相关论文：STARsolo: accurate, fast and versatile m...
TopHat 是一款经典的 RNA-Seq 数据比对软件。它能够精确地将测序 reads 比对到基因组上，并考虑了剪接事件，提高了对剪接变异的检测灵敏度。TopHat 与 Cufflinks 配合使用，曾是转录组数据分析的标准流程，对转录组学的发展做出了重要贡献。然而，随着新工具的出现，TopHat 已经不再推荐使用。TopHat 的...
目前最为流行的 RNA-Seq 数据比对软件是 HISAT2 和 STAR,它们可以说是大浪淘沙后的优胜者。特别值得一提的是,STAR 的升级版 STARsolo 在单细胞测序数据的比对和质控方面得到了越来越广泛的应用,感兴趣的小伙伴可以参考论文:STARsolo: accurate, fast and versatile mapping/quantification of single-cell and singl...