目前最为流行的 RNA-Seq 数据比对软件是 HISAT2 和 STAR,它们可以说是大浪淘沙后的优胜者。特别值得一提的是,STAR 的升级版 STARsolo 在单细胞测序数据的比对和质控方面得到了越来越广泛的应用,感兴趣的小伙伴可以参考论文:STARsolo: accurate, fast and versatile mapping/quantification of single-cell and singl...
当前,RNA-Seq数据比对领域最为流行的软件无疑是HISAT2和STAR,这两者经过激烈竞争,脱颖而出,成为了行业的佼佼者。尤其值得一提的是,STAR的最新版本STARsolo在单细胞测序数据的比对与质量控制方面展现了广泛的应用潜力。对此感兴趣的朋友们,不妨深入了解一下其相关论文:STARsolo: accurate, fast and versatile m...
TopHat 是一款经典的 RNA-Seq 数据比对软件。它能够精确地将测序 reads 比对到基因组上,并考虑了剪接事件,提高了对剪接变异的检测灵敏度。TopHat 与 Cufflinks 配合使用,曾是转录组数据分析的标准流程,对转录组学的发展做出了重要贡献。然而,随着新工具的出现,TopHat 已经不再推荐使用。TopHat 的...
历史信息3 曾担任法定代表人 曾担任股东1 曾担任高管1 所有曾任职企业1 曾为最终受益人0 历史控股企业0 投资信息 控股企业0 间接持股企业0 爱企查图谱 任职全景图 股权穿透图 商业关系图 风险关注 司法案件0 失信被执行人0 限制高消费0 股权出质0 股权冻结0 立案信息0 法院公告0 开庭公告0 裁判文书0 税...
TopHat 是一款经典的 RNA-Seq 数据比对软件,能够精确地将测序 reads 比对到基因组上。其利用 Bowtie 进行快速比对,并考虑了剪接事件,提高了对剪接变异的检测灵敏度。曾经Tophat +Cufflinks作为转录组数据分析的标准流程,不知帮多少人完成了毕业论文,可以说为转录组学的发展立下了汗马功劳。但江山代有人才出,随着新...