总的来说,RNA-BisSeq不需要在细胞中表达外源基因或化学试剂,能够准确捕获细胞和组织中原始的m5C修饰状态。RNA-BisSeq被广泛用于探索各种RNA中m5C的表达特征,并预测其潜在功能,包括哺乳动物、斑马鱼、拟南芥和水稻。RNA-BisSeq中m5C检测的准确性取决于亚硫酸盐处理过程中C到U的转化效率,这受到反应条件(如温度、反应时...
RNA-BisSeq被广泛用于探索各种RNA中m5C的表达特征,并预测其潜在功能,包括哺乳动物、斑马鱼、拟南芥和水稻。RNA-BisSeq中m5C检测的准确性取决于亚硫酸盐处理过程中C到U的转化效率,这受到反应条件(如温度、反应时间)和RNA状态(如RNA质量、RNA二级结构等)的影响(表2)。m6A-SEAL-seq FTO辅助的m6A选择性化学标记测序(m...
通过RNA亚硫酸氢盐测序(RNA-BisSeq),在2012年实现了单碱基分辨率的m5C鉴定。在人赫拉 (HeLa)细胞中,研究人员分别在mRNAs、tRNAs和其他类型的ncRNAs中发现了8495、225和1780个m5C位点。一年后,使用5-氮杂胞苷介导的RNA免疫沉淀(Aza-IP)和miCLIP-Seq,分别鉴定...
在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚硫酸盐处理,将mRNA中未发生甲基化的胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U),进行反转录后形成cDNA;文库制备完成后,通过高通量测序分析,可得m5C 修饰的位点,从而满足您对...
免疫荧光染色和GO分析揭示NSUN2在卵巢癌细胞中的定位和肿瘤相关调控通路。此外,通过RNA-BisSeq、RNA-seq、RIP-seq和ChIP-seq等技术分析了NSUN2介导的基因表达调控,并验证E2F1在NSUN2介导的卵巢癌进展中发挥至关重要的作用。 研究结果 (1)NSUN2在卵巢癌组织中过表达,NSUN2过表达与卵巢癌症患者预后不良相关...
易基因研究团队早在2009年,Nucleic Acids Research发表第一篇亚硫酸盐RNA甲基化m5C检测方案后,就已跟对方合作开展其在高通量测序上的应用,技术可算得上放心!在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚...
易基因研究团队早在2009年,Nucleic Acids Research发表第一篇亚硫酸盐RNA甲基化m5C检测方案后,就已跟对方合作开展其在高通量测序上的应用,技术可算得上放心!在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚...
作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行RNA-BisSeq。经过生信分析,发现在HEK293细胞有12442个m5C位点,在NSUN2-/-HEK293细胞中有3270个m5C位点,在注释mRNA中分别有1142个和376个m5C甲基化位点(A)。且NSUN2下调能够降低m5C甲基化程度(B)和部分染色体上m5C位点数目(C)。但是,NSUN2下调...
研究通过RNA-Bis-seq等分析鉴定出m5C甲基转移酶NSUN2在CRC中表达水平升高及其在CRC中的致癌作用，以及...
研究方法:tRNA Bis-seq、tRNA-seq、Ribo-seq、mRNA-seq、LC-MS/MS 研究主题:翻译失调在肿瘤发生和癌症进展中起关键作用,致癌翻译依赖用于蛋白质合成的tRNA的稳定性和可用性。本研究中先通过免疫组化分析评估甲状腺癌中的NSUN2水平,根据表型测定分析了NSUN2对无结构性甲状腺癌(ATC)恶性程度的影响。再采用LC-MS和...