检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚硫酸盐处理,将mRNA中未发生甲基化的胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U),进行反转录后形成cDNA;文库制备完成后,通过高通量测序分析,可得m5C 修饰的位点,从而满足您对RNA甲基化的科研需求。 RNA-BisSeq实验流程: 5mcRNA甲基化建库示意图 参考...
云序生物具有全面的m6A﹑m5C﹑m1A甲基化MeRIP-Seq产品线,能够对circRNA,LncRNA,mRNA中的各类RNA甲基化修饰进行全面的检测。 图:云序生物MeRIP-seq实验流程 2、云序生物Bis-Seq 适用范围:m5C RNA甲基化; 技术原理:对重亚硫酸盐转化后的RNA进行高通量测序检测; 针对m5C RNA甲基化的修饰还有一种单碱基分辨的检测手段...
检测R-loop位点的实验方法可分为两大类: 一类是基于可特异性识别R-loop的抗体S9.6,代表性的技术是DRIP-seq,该方法的原理与ChIP-seq有些类似,由加州大学Frédéric Chédin团队首次开发,为了提高DRIP-seq的分辨率、特异性或敏感性,后来又出现了DRIPc-seq、bisDRIPseq和ssDRIP-seq等技术,其中ssDRIP-seq由清华大学...
根据测序方法分为m5C-Bis-Seq和m5C-MeRIP两种。 重亚硫酸氢钠测序法(Bis-Seq)→高精确度:是m5C鉴定的金标准,原理是重亚硫酸盐不影响甲基化C,却能将未发生甲基化的C转变成U(尿嘧啶),后者在PCR反应中变成T,并由此将甲基化C与未甲基化C区分开;再结合高通量测序技术,即可得到单碱基分辨率的全基因组m5C修饰图谱...
tf刺激dtomato报告基因的转录。通过对刺激的细胞进行rnaseq,测量了每个样品中每个表达的转录本标签的丰度,然后使用先前建立的结合表,将其制图回到它们相应的结合位点。预期控制 ‑ tf将同等程度地激发所有文库成员,这是因为所有文库元素共有其结合位点,而预期靶标 ...
在体内,用SEQIDNO:29处理后,ApoB-100mRNA表达在肝和空肠中以剂量依赖性方式受到抑制。伴随着下降的ApoB-100水平,血浆中总胆固醇降低70%。还提供了包含本发明寡核苷酸化合物的药物组合物和其它组合物。进一步提供了调节细胞或组织中栽脂蛋白B表达的方法,包括使所述细胞或组织接触本发明的一种或多种寡核苷酸化合物...
在RNA-seq 中,高丰度转录本如核糖体 RNA(rRNA)会占据绝大部分测序数据,但它的生物学意义极低,并会掩盖那些具有真正生物学意义的低丰度转录本的检测。当某种样品没有相应的 RNA 去除试剂盒时,这一挑战变的更为严峻。NEBNext® RNA 去除核心试剂提供客户定制,可以从任意物种中去除不需要的 RNA,探针设计工具操作...
· m5C :Bis-Seq 多组学联合应用 · 选取 目的基因 · qPCR验证 · 甲基化修饰酶敲除 · RNA 甲基化+转录组 · 生信学分析预测 · m6A/ m5C RNA 甲基化测序 · RNA 甲基化+基因组 · 后续功能机制研究 云序生物 Transcriptome Sequencing Expert PART2: RNA 甲基化文章思路 经典案例解析 云序生物 ...
转录调控是生命活动中重要的调控机制,通过chip_seq数据,我们可以得到转录因子或者组蛋白修饰和基因之间的调控关系。chipBase数据库收集了来自10个物种共一万多个样本的chip_seq数据,整理出了转录因子和各种基因,包括蛋白编码基因,lncRNA,miRNA, tRNA等ncRNA之间的调控网络,该数据库网址如下http ...