研究人员首先利用斑马鱼模型，通过转录组测序和RNA亚硫酸盐测序(bisulfite-sequencing，BisSeq)，描绘了AGM区新生HSPC、CHT区HSPC和成体肾髓区HSPC的转录和RNA m5C水平的动态变化规律，发现RNA m5C偏好于修饰阶段功能特异性转录本，其水平在CHT区HSPC中特异性升高。并且从AGM区新生HSPC发育至CHT区HSPC过程中，m5C修饰水平...
功能缺失实验和回救实验验证了Ybx1调控CHT区HSPC扩增,并且这一调控作用依赖于Ybx1的m5C位点识别及结合能力。转录组、RNA BisSeq和Ybx1 RNA免疫沉淀测序(RNA immunoprecipitation sequencing, RIP-seq)分析和功能实验表明,Ybx1主要结合含有m5C修饰的细胞周期相关转录本,如cyclin d1和mcm6,并维持其稳定性。ybx1缺失后HS...
研究人员首先利用斑马鱼模型,通过转录组测序和RNA亚硫酸盐测序(bisulfite-sequencing,BisSeq),描绘了AGM区新生HSPC、CHT区HSPC和成体肾髓区HSPC的转录和RNA m5C水平的动态变化规律,发现RNA m5C偏好于修饰阶段功能特异性转录本,其水平在CHT...
m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C普遍存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。我们率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫酸盐处理的方式进行测序(Bisulfite Sequencing, 简称 Bis-seq)。在全转录...
m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C普遍存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。我们率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫酸盐处理的方式进行测序(Bisulfite Sequencing, 简称 Bis-seq)。在全转录...
易基因研究团队早在2009年,Nucleic Acids Research发表第一篇亚硫酸盐RNA甲基化m5C检测方案后,就已跟对方合作开展其在高通量测序上的应用,技术可算得上放心!在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚...
在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚硫酸盐处理,将mRNA中未发生甲基化的胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U),进行反转录后形成cDNA;文库制备完成后,通过高通量测序分析,可得m5C 修饰的位点,从而满足您对...
研究人员首先利用斑马鱼模型,通过转录组测序和RNA亚硫酸盐测序(bisulfite-sequencing, BisSeq),描绘了AGM区新生HSPC、CHT区HSPC和成体肾髓区HSPC的转录和RNA m5C水平的动态变化规律,发现RNA m5C偏好于修饰阶段功能特异性转录本,其水平在CHT区HSPC中特异性升高。并且从AGM区新生HSPC发育至CHT区HSPC过程中,m5C修饰水平增...
To facilitate the detection of m(5)C in its sequence context, RNA bisulfite sequencing (RNA-BisSeq) has been developed. This method relies on the efficient chemical deamination of nonmethylated cytosine, which can be read out as single nucleotide polymorphism (nonmethylated cytosine as thymine vs...
近年来, m5C修 饰高通量测序技术得到迅速发展, 包括RNA重亚硫酸 盐测序(RNA-BisSeq),m5C-RNA免疫沉淀测序(RNA m5C-RIP),甲基化-单核苷酸分辨率交联和免疫沉淀 1510 https://engine.scichina.com/doi/10.1360/SSV-2023-0127 中国科学: 生命科学 2023 年第 53 卷第 11 期 测序(methylation individual-...