转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
RNA-seq,RNA-seq(RNA sequencing)即转录组测序技术,就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。在过去的十年中,RNA-Seq技术迅速发展,并成为了在转录组水平上分析差异基因表达/mRNA可变剪切的不可缺少的工具。随着
也可以通过基于液滴的微流控技术(例如在Drop-Seq,InDrop中)分离单细胞并与后续反应试剂包裹在一个液滴中,或者采用原位序列条形码标记(例如单细胞组合索引RNA测序(sci-RNA-seq)和基于分池连接的转录组测序(split-pool ligation-based transcriptome sequencing, SPLiT-seq))。
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RNA exome方法使用寡核苷酸探针来捕获RNA-seq文库分子,非常类似于外显子测序 (exome sequencing)使用的策略。这两种方法应用简单,并都能在保留降解的和片段化的mRNA的前提下降低混入的rRNA的影响,进而获得高质量的和高稳定性的基因表达数据。3ʹ末端标记测序技术与扩增子测序(PCR扩增超过2万个外显子)方法也可以...
到目前为止,已从标准的RNA-seq流程中衍生出多达100种不同的应用。大部分应用都是基于Illumina short-read测序,但最近基于long-read RNA-seq和direct RNA sequencing (dRNA-seq)的方法可以帮助解决Illumina short-read技术处理不了的问题。 本文中,我们先熟悉'baseline'流程,用short-read RNA-seq技术分析DGE。先描述...
目前,RNA-seq方法可用于研究RNA生物学的许多不同方面,包括单细胞基因表达、翻译和RNA结构。随着直接RNA-seq技术和更好的数据分析工具的出现,RNA-seq的发展有助于更全面地理解生物科学,本文解读一篇2019年发表在Nature的RNA-sequencing综述。 DGE:基因差异表达 ...
‹Sequencing RNA Sequencing (RNA-Seq) Transcriptome Sequencing Targeted RNA Sequencing for Gene Expression Analysis Using NGS DNA Sequencing Next-Generation Sequencing (NGS) Epigenetic Sequencing Sequencing Technology Solutions Fragment Analysis Sanger...
RNA-Seq(RNA sequencing),也称为全转录组测序,是一种利用深度测序技术来研究样本的RNA组成的技术。这种技术能够提供关于细胞中RNA存在性和丰度的信息,可以用来鉴定和量化在特定时间点或条件下所有类型的RNA分子,包括mRNA、非编码RNA和小RNA。 RNA-Seq开始于RNA的抽取和纯化。接着,通常会使用一种叫作逆转录的过程将...