这些为最终探明RNA和蛋白质相互作用的分子机制,从而从本质上认识相关的细胞生理过程打下实的基础。 一.RNA pull down 技术应用 1.癌症肿瘤相关调控机制研究 LncRNA发挥功能的方式很广,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,主要包括基因组表观遗传修饰、调控转录翻译、发挥ceRNA、增强子RNA作用等,...
基于免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)的技术是我们研究蛋白与其它大分子类分子互作的关键技术之一,比如研究蛋白与蛋白互作的Co-IP,蛋白与RNA互作的RIP,蛋白与DNA互作的ChIP,其基本原理就是通过要研究目的蛋白的抗体进行免疫共沉淀,接下来根据要检测的分子类型通过各种方法进行检测。 根据检测的目的,也可以分为寻找和确认...
一、RIP RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。 简而言之,RIP是在已知蛋白的情况下,利用目标蛋白的抗体,把蛋白和RNA复合物一起沉淀下来,然后经过分离纯化获得结合在复合物上的RNA,最后通过microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq...
LncRNA是一类大于200nt的非编码RNA分子,在个体发育和疾病进程中都发挥了重要的作用。近年来,LncRNA的研究重点已经从早期的大规模鉴定,转移到了对具体的某个LncRNA的功能和机制的探索。 LncRNA主要通过与其他分子相互作用发挥功能,包括RNA,DNA和蛋白。其中...
蓝景科信推出一种全新的鉴定与蛋白结合的RNA技术平台:RNA亲和纯化测序技术(RNA Affinity Purification Sequencing, RAP-seq)。该技术是通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的RNA结合蛋白,然后与RNA在体外进行孵育和结合,再分离出与目的RBP结合的RNA,进行建库与高通量测序,通过生物信息学分析,可以鉴定出蛋白质结合的mRNA、...
电泳迁移率改变实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)是常用的研究核酸-蛋白相互作用的技术,基本原理是如果核酸分子与蛋白存在相互作用,电泳中会因为两者结合而导致电泳速度变慢,通过杂交实验可以看出具体的变化状态。该实验的操作相对简单,还能进行定量分析,是研究RNA-蛋白相互作用非常有用的技术。
翻译过程不可避免的涉及到了RNA与蛋白的结合,而目前对于RNA与蛋白相互作用的研究,并无通用方法进行RNA结合蛋白的纯化。基于此,cell杂志再出力作,提出一种新的名为XRNAX的方法,针对RNA交联蛋白进行纯化,并采用此纯化富集手段,建立了RNA与...
翻译过程不可避免的涉及到了RNA与蛋白的结合,而目前对于RNA与蛋白相互作用的研究,并无通用方法进行RNA结合蛋白的纯化。基于此,cell杂志再出力作,提出一种新的名为XRNAX的方法,针对RNA交联蛋白进行纯化,并采用此纯化富集手段,建立了RNA与蛋白相互作用数据库,发现了700多个非多聚腺苷互作蛋白。
RNA-蛋白质相互作用在转录后基因调控中至关重要。随着RNA测序技术和高效液相质谱联用的蛋白质组学技术的快速发展,将这些创新的化学生物工具与生物学研究相结合,预示了在细胞水平研究分子的互作将成为可能。本文作者描述了蛋白质组学和转录组学方法在开发和应用细胞RNA-蛋白质互作方面的最新研究进展,重点聚焦基于测序技术...
翻译过程不可避免的涉及到了RNA与蛋白的结合,而目前对于RNA与蛋白相互作用的研究,并无通用方法进行RNA结合蛋白的纯化。基于此,cell杂志再出力作,提出一种新的名为XRNAX的方法,针对RNA交联蛋白进行纯化,并采用此纯化富集手段,建立了RNA与蛋白相互作用数据库,发现了700多个非多聚腺苷互作蛋白。