在RNA的整个生命周期中，非编码RNA序列，如长链非编码RNAs、小核仁RNAs以及非翻译mRNA区域，都发挥着至关重要的作用。它们能够与RNA结合蛋白（RBPs）发生直接相互作用，从而实现对RNA表达和功能的多样化调控。RNA与蛋白质的相互作用对于细胞稳态的维持至关重要，而这一相互作用的干扰与细胞功能失调及多种疾病的发生密切...
就目前的发现而言,绝大多数的lncRNA发挥功能都是通过lncRNA-蛋白相互作用的方式来介导的。lncRNA通过与蛋白形成RNA-protein 复合物发挥多样性的功能,例如染色体调控复合物、转录因子及RNP复合物。因此,研究lncRNA-蛋白相互作用的技术可以帮助我们解开lncRNA的生物学功能。常用的用于研究lncRNA-蛋白相互作用的技术,请参见...
蛋白质-RNA相互作用是指蛋白质与RNA分子之间的互相作用。这种相互作用在许多重要的生物学过程中起着关键作用,如转录、翻译和RNA后转录调控等。 其中,蛋白质可以通过直接与RNA结合来调节其功能和稳定性。例如,转录因子是一种能够识别DNA序列并在合适的条件下结合DNA的蛋白质。在转录过程中,这些转录因子可调控RNA的合成...
RIP是指RNA Binding Protein Immunoprecipitation，同RNA pulldown相似，也是一种研究RNA和蛋白相互作用的方法，但与RNA pulldown的出发点不同， RIP是从蛋白出发研究蛋白RNA相互作用的技术。就是已知一个蛋白，把与蛋白结合的RNA富集出来并鉴定，以证实蛋白与RNA间的互作。一、RIP 的基本原理 1.用抗体捕获细胞核内或...
对于一种特定的RNA(如,lncRNA,mRNA,circRNA,microRNA,tRF&tiRNAs等),往往具有与之对应的相互作用蛋白共同执行特定的生理功能,以lncRNA为例,近年来,lncRNAs在基因表达调控方面的重要功能越来越被人们所关注,但它们的具体功能还有待阐明。LncRNA可能通过4种作用机制参与基因调控:Decoy,作为诱饵分子,替代蛋白与DNA的相互...
其中,电荷相互作用是最为重要的一种作用形式,因为RNA的碱基(如尿嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶等)带有负电荷,而蛋白质的一些原子群(如氨基、羧基、咪唑等)带有正电荷,在相互作用中可以互相吸引。同时,氢键也在蛋白质与RNA的相互作用中起到了重要的作用,因为RNA中的氢键配对规则比较特殊,在蛋白质与RNA相互作用的过程中,...
研究人员可通过RNA-蛋白质交联鉴定体内两者的相互作用,原理是在变性情况下,排除非共价结合的相互作用,纯化RNA,接着只提取发生交联的蛋白以用于鉴定。 甲醛是一种小的双功能交联剂,可以很容易地渗透细胞并交联2Å距离内的大分子,包括蛋白质—蛋白质,蛋白质—DNA和蛋白质—RNA复合物,形成可逆的共价连接,导致很难区分...
描述符是用来表示RNA或蛋白质分子特征的数值,它可以用来描述分子的结构、序列、功能等特征。这些描述符可以用来预测RNA-蛋白相互作用。 常用的RNA-蛋白相互作用预测描述符包括RNA结构、蛋白质结构、RNA序列、蛋白质序列、RNA功能、蛋白质功能等。这些描述符可以用来预测RNA-蛋白相互作用。需要注意的是,RNA-蛋白相互作用...
1. 染色质三维结构研究:CHIRP实验可用于研究RNA在染色质三维结构中的作用,揭示RNA在基因表达调控中的分子机制。 2. RNA-蛋白质相互作用研究:CHIRP实验可用于研究RNA-蛋白质相互作用,进一步探究RNA在蛋白质调控、信号传递等方面的作用。 3.染色质修饰研究:CHIRP实验可用于研究与染色质修饰相关的RNA分子,如Xist RNA与...
酵母三杂交系统检测和分析RNA-蛋白相互作用实验 实验方法原理 酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可…