PROTAC-DB 3.0的更新内容概览 [访问链接:http://cadd.zju.edu.cn/protacdb/] 与在前两个版本(PROTAC-DB 1.0和2.0)中收集数据的方法一致,作者团队使用关键词‘degrader* OR proteolysis targeting chimera’在PubMed数据库中搜索原始论文,对于每篇文章,手动收...
大家在登陆进入数据库主页后,可以看到PROTAC-DB共包含了1662个PROTAC,202个弹头,65个E3配体和806种连接体。大家可以在搜索框里搜索靶标和PROTAC及其组成部分的名字。 2 结构绘制和搜索 在这一模块里,大家可以通过在大的空白方框中绘制PROTAC的结构来进行搜索,也可以通过上传自己已经设计好了的结构,在设置好相关参...
目前PROTAC的设计仍然是一个巨大的挑战,为了对PROTACs进行合理设计,本文提出了一个基于Web的开放式数据库PROTAC-DB,它集成了PROTACs的结构信息和实验数据。目前,PROTAC-DB已经囊括了1662个PROTAC、202个弹头(靶向目标蛋白质的小分子)、65个E3配体(能够招募E3连接酶的小分子)和806个Linker以及它们的化学结构、生物活性...
近日，浙江大学药学院侯廷军教授课题组在 Nucleic Acids Research 期刊发表了题为：PROTAC-DB 2.0: an updated database of PROTACs 的论文，对初代PROTAC-DB做出了重大更新。PROTAC-DB始建于2020年，是首个PROTAC在线数据平台，囊括了化学结构、生物活性、理化性质在内的多种数据，现已成为PROTAC领域的重要数据...
PROTAC-DB 3.0较上一版数据库更新近一倍数据 基于分子相似性的搜索和排序 根据文献发表日期进行搜索结果排序 总结 参考资料 蛋白水解靶向嵌合体(Proteolysis-targeting chimera,PROTAC)是一种利用泛素-蛋白酶体系统靶向蛋白质降解的新兴治疗技术。然而,这一技术仍处于待成熟阶段,PROTAC分子的理性设计仍然是一个巨大的挑...
在检索工具上,PROTAC-DB可以进行基于文本的检索和基于结构的检索。基于文本的搜索是在整个PROTAC-DB中进行搜索的一种简单方式,只需输入单个术语,如目标名称、化合物名称或ID。对于基于结构的搜索,用户可以在ChemDoodle编辑器中输入SMILES字符串、上传MOL/SDF文件或绘制分子草图。导入自编辑的分子后,可以从三个搜索选项...
大厂们与Protac Biotech的密集合作,让部分敏锐的投资者可能嗅到机会,Protac的商业化时代可能将加速来临。 01 先驱Arvinas,也是最可能被收购的标的 金融服务公司Cantor Fitzgerald预计2024年将是肿瘤药物行业并购活动强劲增长的一年,蛋白降解先驱企业Arvinas被其列为最有可能被并...
dBRD9 是一种 PROTAC,能选择性的降解 BRD9。dBRD9 改进了溴域接合剖面,降低了整个 BET 家族的结合活性。相关厂家报价 产品名称价格公司名称报价日期 化合物dBRD9|T31221|TargetMol ￥987 VIP3年 TargetMol中国(陶术生物) 2024-12-12 dBRD9 询价 北京百奥创新科技有限公司 ...
靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)是一种双功能分子,由结合靶蛋白(POI)配体、E3连接酶结合配体和连接它们的Linker三部分组成,可利用体内天然存在的泛素-蛋白酶体系统(UPS)降解致病蛋白从而达到治疗疾病的目的。该技术已经成为一种全新的药物开发手段,并得到科研院所、药企和投资机构的青睐。截至目前,有19款PROTAC药物处于临...
除此之外,一些国内的药企比如开拓药业、凌科药业、海思科、美志医药、睿跃生物、海创药业和万春医药子公司Seed Therapeutics等均已在PROTAC领域布局。本期内容我们来看看开拓药业和凌科药业的PROTAC管线。 01开拓药业开拓药业成立于2009年,专注发展以皮科和肿瘤等相关疾病为核心,尤其是雄激素受体相关的潜在“best-in-...