RNAi和miRNNA都干扰mRNA，RNAi被发现的时候，科学界还不知道生命体内源性会产生具有基因调控作用的miRNA。由于是内源性产生的，从进化论的角度来说miRNA在基因表达或疾病的调控方面更具科学性，而RNAi的方法相对人工化。将来我们做RNA干扰时，希望这两种方式都可用。基于这两种方法产生的产品目的基本上是一样的。miRN...
约20%(但仅约2%)的mrna与PRC2[^18]相互作用，其他lncrna与其他染色质修饰复合物相互作用。
lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA调控关系如Sankey图(图7H和图7I)。总共5个lncRNA、6个circRNA、8个miRNA和5个mRNA构成了ceRNA网络(图7J)。 5.关键基因在肝细胞癌中的诊断和预后价值 对ceRNA网络中的关键基因进行ROC曲线分析。结果表明,所有mR...
在 BC 中确定的 miRNA-mRNA 调控网络已经成熟,可以用作生物标志物或靶向治疗策略。 Keywords:膀胱癌, miRNA, 突变, miRNA-mRNA网络 去: 背景 膀胱癌 (BC) 是泌尿道的一个全球性问题,在死亡率和发病率方面统计上排在第五位 [1]。BC 发病...
第一步,分别在TCGA上下载mRNA和miRNA数据 第二步,分别提取相应表达矩阵 第三步,分别做miRNA和mRNA的差异表达分析 第四步,将mRNA和miRNA合并为一个矩阵 第五步,WGCNA分析 第六步,Cytoscape构建共表达网络 希望本文对大家有所帮助,本文来源于微信公众号SCI狂人,版权归SCI狂人团队所有。
首次在OA软骨细胞中发现了由16个differentially expressed circRNAs(DECs)、32个DETMs(target DEMs)和97个DETGs(target DEGs)构成的circRNA-miRNA-mRNA调控网络;hsa_circ_0027914、hsa_circ_0101125和hsa_circ_0102564被确定为在OA中的中心DECs。体外验证实验表明这三种中枢DECs的促凋亡功能及其作为OA新生物标志物的潜力...
研究利用mRNA和miRNA测序技术,对我国特色山羊品种-云上黑山羊的卵巢组织进行研究。通过构建miRNA-mRNA网络,筛选了调控山羊高繁殖力的潜在分子途径,并通过体外实验对候选基因及其调控基因进行了验证。确定了chi-miR-439-3p-JAK3调控通路,为云上黑山羊GC的增殖和繁殖力提供了新的视角。菲沙基因为本文共同作者,参与了本...
预测肝硬化患者肝癌发生的候选lncRNA-miRNA-mRNA网络:综合生物信息学分析 摘要 目的：本研究通过生物信息学分析，探索潜在的竞争性内源性RNA (ceRNA)网络在肝硬化患者HCC发展中的作用。方法：利用GEO和TCGA数据库的数据挖掘，挖掘mRNA、lncRNA和miRNA差异表达谱。在匹配的HCC队列中，RT-PCR证实了他们的表达(n = 6/...
这些分享一篇简单、快捷、容易实现的参考范文(基本上人人都会操作):作者通过下载GEO数据库的miRNA和mRNA数据构建miRNA‑mRNA调控网络进行发文。这篇范文发表在PLoS one上,也就是科研人常常提到的“江湖四大神刊”之一,影响因子:2.74,中科院最新分区:2区。参考文章来源:PMID: 33434215 DOI:10.1371/journal.pone.0244394...
而一个基因往往受到数个甚至数百个miRNA的调控（而这些估计主要是基于miRNA通过种子序列结合到靶基因 mRNA的3’ UTR这一基础，如果考虑不同的结合序列以及不同的结合位点，这一数字将更为可观）。因此，miRNA的基因调控作用将是一个复杂的网络状结构，如图6所示[13]。图6. miRNA调控网络示意图 这样的结构会带来两...