合并miRNAs与靶基因总集的蛋白质互作关系,从而建立miRNA-mRNA的调控网络。 图5. miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,圆形表示mRNA,红色线条表示miRNA对mRNA的调控关系,蓝色线条为mRNA之间的蛋白质互作关系 6. 预测调控miRNA的转录因子(Transcript Factor) 1)基于调控因子结合位点数据库,利用相应算法进行调控因子及结合位点...
3、 limma-voom分析H19高低表达组,鉴定上下调miRNA,TF,gene。 4、 选择符合以下要求(1)H19(↓)——靶miRNA(↑)——靶tf或靶基因(↓);(2)H19(↑)——靶miRNA(↓)——靶tf或靶基因(↑)的三联体进行细胞实验验证。 结果: 1. H19在24种癌症中的表达水平分析 从TCGA中提取24种癌症中lncRNAs、TFs和基因...
miRNA-TF-mRNA网络分析网络分割算法核心基因【目的】 1.通过研究消化道癌症转录数据分析消化道癌症共享表达模式并分析癌症间共享分子机制. 2.利用网络分解算法分割转录调控网络成紧密互作的子网.通过分析紧密互作的子网基因评价和分析消化道癌症之间重要的分子功能与基因. 3.构建消化道癌症miRNA-TF-mRNA调控网络,藉网络...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
内容提示: 学校代码: 10571 学 号: 201801401 密 级: 公 开 基于 miRNA-TF-mRNA 转录调控网络识别消化道癌症间共享功能与 关键基因 Unraveling the shared function and pivotal genes of gastrointestinal tract cancers via miRNA-TF-mRNA transcriptional regulatory network 学科门类 医 学学科、专业 公共卫生 ...
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景：microRNA Exportin5 •microRNA（简称miRNA)是一类内源的，长度约为21~25nt，与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物，其主要通过miRNA5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’端非编码区（3’UTR）不完全互补，进而抑制蛋白质翻译或降解mRNA,从而发挥重要的...
TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景:microRNA microRNA(简称miRNA)是一类内源的,长度约为21~25nt,与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物,其主要通过miRNA 5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’ 端非编码区(3’UTR)不完全互补,进而抑制蛋白质翻译或降解mRNA, 从而发挥重要的调控功能。miRNA...
根据差异mRNA、miRNA和lncRNA,通过Tansfac数据库预测其前体的转录因子,并将预测的转录因子与mRNA、miRNA和lncRNA构建TF-Network网络。该网络反映mRNA、miRNA、lncRNA与转录因子的调控关系,系统的研究转录因子与基因的调控关系,从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因。
1. 输入用户自定义的miRNA和mRNA集合,可以是发生差异表达或者满足其他筛选标准的集合。 2. 设定阈值,与哪种疾病相关,相关标准选择exprimental,predicted,both 3. 鼠标点击运行即可接下来就可以分析结果了。 4. 结果首先展示疾病的特异网络,只含有疾病相关基因的节点和边的关系;另外一个就是全局的大网。 接下来按节...