miRNA-TF-mRNA网络分析网络分割算法核心基因【目的】 1.通过研究消化道癌症转录数据分析消化道癌症共享表达模式并分析癌症间共享分子机制. 2.利用网络分解算法分割转录调控网络成紧密互作的子网.通过分析紧密互作的子网基因评价和分析消化道癌症之间重要的分子功能与基因. 3.构建消化道癌症miRNA-TF-mRNA调控网络,藉网络...
内容提示: 学校代码: 10571 学 号: 201801401 密 级: 公 开 基于 miRNA-TF-mRNA 转录调控网络识别消化道癌症间共享功能与 关键基因 Unraveling the shared function and pivotal genes of gastrointestinal tract cancers via miRNA-TF-mRNA transcriptional regulatory network 学科门类 医 学学科、专业 公共卫生 ...
TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
绿色圆形表示TF,菱形表示miRNA 7. 合并TF-miRNA调控关系及miRNA-mRNA作用关系来构建miRNA调控网络。 图7. TF-miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,绿色圆形表示TF,蓝色圆形表示mRNA,箭头表示调控关系,线条表示蛋白质互作。 参考文献 1. Friedman RC, Farh KK, Burge CB, et al. Most mammalian mRNAs are conserved...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
根据差异mRNA、miRNA和lncRNA,通过Tansfac数据库预测其前体的转录因子,并将预测的转录因子与mRNA、miRNA和lncRNA构建TF-Network网络。该网络反映mRNA、miRNA、lncRNA与转录因子的调控关系,系统的研究转录因子与基因的调控关系,从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因。
Ye S; Yang L; Zhao X; etal.Bioinformatics method to predict two regulation mechanism: TF-miRNA-mRNA and lncRNA- miRNA-mRNA in pancreatic cancer.Cell Biochem Biophys.2014.1849-1858S. Ye, L. Yang, X. Zhao, W. Song, W. Wang, S. Zheng, Bioinformatics method to pre- dict two regulation...
networkanalyst使用|预测TF-gene,TF-miRNA,disease-chemical等相互作用网络并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 5093 0 06:39 构建ceRNA网络方法。ceRNA图。生物信息 mRNA-lncRNA-miRNA图 生信分析666 1.9万 10 11:54 networkanalyst网站结合cytoscape软件构建gene-mirna-tf三联互作网络图 熬夜干科研 731 1 14:...
匹配出负向调节的miRNA-TF关系队,最后构建BPD患儿潜在miRNA-TF-mRNA调控网络,进一步筛选出关键miRNA,mRNA.结果共筛选出201个差异表达基因,KEGG富集结果主要涉及B细胞受体信号通路,造血系统,原发免疫缺陷等作用,GO功能富集分析主要富集在B细胞增殖活化及免疫应答调节细胞表面受体等生物学过程中.与Hub TF(EBF1,TCF4,JUN...
Identification of miRNA-mRNA-TF regulatory networks in peripheral blood mononuclear cells of type 1 diabetesType 1 diabetes (T1D)MicroRNAsDifferentially expressed genes (DEGs)Transcription factors (TFs)Regulatory networksThe constructed regulatory networks, including miR-320a/ ADM/SOX5 and miR-320a/ ...