利用STRING构建511个mRNA的基因相互作用网络,得到了534个mRNA‑mRNA调控关系对。此外,还根据两个miRNA之间的共同基因靶标,筛选出15对miRNA‑miRNA。最后,通过合并miRNA‑TF、TF‑mRNA、mRNA‑mRNA和miRNA‑miRNA的调控关系对,构建包含...
5. 构建miRNA-mRNA网络 合并miRNAs与靶基因总集的蛋白质互作关系,从而建立miRNA-mRNA的调控网络。 图5. miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,圆形表示mRNA,红色线条表示miRNA对mRNA的调控关系,蓝色线条为mRNA之间的蛋白质互作关系 6. 预测调控miRNA的转录因子(Transcript Factor) 1)基于调控因子结合位点数据库,利用相应算...
5. 构建miRNA-mRNA网络 合并miRNAs与靶基因总集的蛋白质互作关系,从而建立miRNA-mRNA的调控网络。 图5. miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,圆形表示mRNA,红色线条表示miRNA对mRNA的调控关系,蓝色线条为mRNA之间的蛋白质互作关系 6. 预测调控miRNA的转录因子(Transcript Factor) 1)基于调控因子结合位点数据库,利用相应算...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
通过与mRNA共享共同的miRNA结合位点或引导miRNA降解,lncRNA通过与miRNA相互作用与miRNA靶基因(TF或非TF基因)竞争。尽管lncRNA在癌症中发挥重要作用,但它如何在复杂而动态的细胞系统中发挥调控作用仍是很大程度上的未知,特别是在泛癌症水平上。在这篇文章中,开发了一种分析策略来探索lncRNA、miRNA、TFs和基因之间的协同...
TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
5’UTR就是5‘端的非翻译区,是针对已经转录过的mRNA而言,对翻译会有影响,miRNA的作用就与5’UTR有关;而启动子则是在DNA水平,启动转录的,不存在于转录后的mRNA。两者是不一样的。 六、转录起始位点是启动子吗? 不是。启动子是一段序列,转录位点是一个碱基。不能相等同。
支气管肺发育不良微小核糖核酸转录因子信使核糖核酸基因调控网络目的筛选与新生儿支气管肺发育不良(BPD)发病相关的关键转录因子(TF),微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA),并构建了调控网络.方法从高通量基因表达数据库GEO获取mRNA芯片数据集GSE108756,筛选出的差异表达基因(DEGs)进行京都基因和基因百科全书(KEGG),基...
ceRNA,全称competing endogenous RNAs,竞争性內源RNA,其实是几类RNA的总称,泛指可以竞争结合microRNA的mRNA,假基因转录物和lncRNA,是一种全新的基因调控模式。涉及这么多不同种类的RNA,从何下手呢? 毛主席有一句至理名言,啥,事物要抓主要矛盾啊。从ceRNA的定义中我们就可以看到枢纽在哪,在microRNA啊。思路有了没?
networkanalyst｜预测TF-gene等相互作用网络并用Cytoscape作图 今天想带大家来学习 networkanalyst 这个网站的使用方法，那这个网站可以用来分析 TF -gene、 TF 与 miRNA ,gene-miRNA，protein-chemical 等等它们之间的相互作用。我们还是来先看一下文件里，那这个文件它就是用 networkanalyst分析了 TF -gene以及TF-mRNA，...