接着,利用蛋白质‑蛋白质相互作用的数据库(STRING),将置信度设置为0.4,获得mRNA的调控关系对,并基于两个miRNA之间的共同靶点mRNA而得到miRNA‑miRNA的调控关系对,即两个miRNA之间至少有2个共同的靶点mRNA。通过合并miRNA‑mRNA、mRNA‑...
合并miRNAs与靶基因总集的蛋白质互作关系,从而建立miRNA-mRNA的调控网络。 图5. miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,圆形表示mRNA,红色线条表示miRNA对mRNA的调控关系,蓝色线条为mRNA之间的蛋白质互作关系 6. 预测调控miRNA的转录因子(Transcript Factor) 1)基于调控因子结合位点数据库,利用相应算法进行调控因子及结合位点...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
通过与mRNA共享共同的miRNA结合位点或引导miRNA降解,lncRNA通过与miRNA相互作用与miRNA靶基因(TF或非TF基因)竞争。尽管lncRNA在癌症中发挥重要作用,但它如何在复杂而动态的细胞系统中发挥调控作用仍是很大程度上的未知,特别是在泛癌症水平上。在这篇文章中,开发了一种分析策略来探索lncRNA、miRNA、TFs和基因之间的协同...
TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景：microRNA Exportin5 •microRNA（简称miRNA)是一类内源的，长度约为21~25nt，与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物，其主要通过miRNA5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’端非编码区（3’UTR）不完全互补，进而抑制蛋白质翻译或降解mRNA,从而发挥重要的...
根据差异mRNA、miRNA和lncRNA,通过Tansfac数据库预测其前体的转录因子,并将预测的转录因子与mRNA、miRNA和lncRNA构建TF-Network网络。该网络反映mRNA、miRNA、lncRNA与转录因子的调控关系,系统的研究转录因子与基因的调控关系,从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因。
3.细胞类型特异的基因调控网络细胞类型特异的基因调控网络（TMTN，TF-miRNA-target gene network）也在...
转录因子调控网络——TF Network 根据差异mRNA、miRNA和lncRNA,通过Tansfac数据库预测其前体的转录因子,并将预测的转录因子与mRNA、miRNA和lncRNA构建TF-Network网络。该网络反映mRNA、miRNA、lncRNA与转录因子的调控关系,系统的研究转录因子与基因的调控关系,从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因。
1. 输入用户自定义的miRNA和mRNA集合,可以是发生差异表达或者满足其他筛选标准的集合。 2. 设定阈值,与哪种疾病相关,相关标准选择exprimental,predicted,both 3. 鼠标点击运行即可接下来就可以分析结果了。 4. 结果首先展示疾病的特异网络,只含有疾病相关基因的节点和边的关系;另外一个就是全局的大网。 接下来按节...