在 BC 中确定的 miRNA-mRNA 调控网络已经成熟,可以用作生物标志物或靶向治疗策略。 Keywords:膀胱癌, miRNA, 突变, miRNA-mRNA网络 去: 背景 膀胱癌 (BC) 是泌尿道的一个全球性问题,在死亡率和发病率方面统计上排在第五位 [1]。BC 发病...
当miRNA被装载到RISC复合物中后，便可以发挥其基因表达调控的作用。miRNA会通过其种子序列（5 ’端第2-8位核苷酸）识别靶基因mRNA 3’UTR上的结合位点，携带RISC发挥作用。miRNA的作用效果主要有三种：转录抑制（transcriptional repression），mRNA的切割或降解（mRNA cleavage or degradation）。转录抑制涉及到一个重要...
1.创新点 首次在OA软骨细胞中发现了由16个differentially expressed circRNAs(DECs)、32个DETMs(target DEMs)和97个DETGs(target DEGs)构成的circRNA-miRNA-mRNA调控网络;hsa_circ_0027914、hsa_circ_0101125和hsa_circ_0102564被确定为在OA中的中心DECs。体外验证实验表明这三种中枢DECs的促凋亡功能及其作为OA新生物标...
文章还有部分补充数据，对于lncRNA–miRNA–mRNA调控网络的预测方法大致总结为：1.DEGs、DEMs和DELs的鉴定（DEGs：差异表达的基因，DELs：差异表达的长非编码RNA，DEMs：差异表达的microRNAs，lncRNA：长非编码RNA，miRNA：microRNA，mRNA：messager RNA）→以火山图或热图呈现。2. 功能富集分析：了解相关的DEGs的功能。...
miRNA 不仅调控单个靶mRNA，往往在细胞中形成复杂的调控网络。一个miRNA可以调控多个靶基因，而一个基因的...
lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA调控关系如Sankey图(图7H和图7I)。总共5个lncRNA、6个circRNA、8个miRNA和5个mRNA构成了ceRNA网络(图7J)。 5.关键基因在肝细胞癌中的诊断和预后价值 对ceRNA网络中的关键基因进行ROC曲线分析。结果表明,所有mR...
文章还有部分补充数据,对于lncRNA–miRNA–mRNA调控网络的预测方法大致总结为: 1.DEGs、DEMs和DELs的鉴定(DEGs:差异表达的基因,DELs:差异表达的长非编码RNA,DEMs:差异表达的microRNAs,lncRNA:长非编码RNA,miRNA:microRNA,mRNA:messager RNA)→以火山图或热图呈现。
miRNA是一类小的非编码RNA,由于它会通过mRNA的转录后抑制协调基因表达网络,具有强大的调节能力,成为RNA中重点研究的对象。已有研究发现miRNA会通过结合3’UTR序列并诱导脱腺苷酸化(CCR4-NAT和PAN2-PAN3复合物)、去帽化(DCP2和相关因素)和5’-3’降解(XRN1外核糖核酸酶),降低靶mRNA的翻译能力和稳定性[1]。
据估计,miRNA能调节人类近1/3的基因。而一个基因往往受到数个甚至数百个miRNA的调控(而这些估计主要是基于miRNA通过种子序列结合到靶基因 mRNA的3’ UTR这一基础,如果考虑不同的结合序列以及不同的结合位点,这一数字将更为可观)。因此,miRNA的基因调控作用将是一个复杂的网络状结构,如图6所示[13]。
1、在GEO数据库上搜索相关的miRNA和mRNA数据，然后下载整理进行差异分析 2、对差异的miRNA进行GO、KEGG富集分析 3、对差异基因进行PPI分析并筛选出重要的子网络，同时也对差异基因进行GO、KEGG富集分析 4、构建miRNA-mRNA网络 5、对网络中的差异基因进行生存分析 总结：这篇文章发文思路比较简单，文章图片清晰整洁，...