根据对应关系,建立了miRNA-mRNA网络(图6B)。这些预测的miRNA的表达数据在OncomiR数据库中获得。结果发现只有15个有显着差异表达(表2)。在上述miRNA的基础上,利用StarBase和LncBase获得了106个常见的lncRNA-miRNA调控对(图7A)。与GEPIA的表达...
首次在OA软骨细胞中发现了由16个differentially expressed circRNAs(DECs)、32个DETMs(target DEMs)和97个DETGs(target DEGs)构成的circRNA-miRNA-mRNA调控网络;hsa_circ_0027914、hsa_circ_0101125和hsa_circ_0102564被确定为在OA中的中心DECs。体外验证实验表明这三种中枢DECs的促凋亡功能及其作为OA新生物标志物的潜力...
mirna是由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA(核糖核酸)分子,大小约为21-23个碱基。mRNA翻译成肽链的过程受调节因子的调控,大多数miRNA可以调节特定的相应mRNA翻译成蛋白质。目前已有研究表明,由circRNA失衡引起的miRNA和mRNA的表达紊乱可驱动多种癌症的发生和转移。因此,以circRNA为核心的分子调控网络可...
结果筛选出278个差异表达mRNA、23个差异miRNA和2402个差异circRNA(P<0.05和|log2FC|>0.8);构建256条circRNA-miRNA-mRNA调控网络,包含13个mRNA、2个miRNA和40个circRNA;临床验证后提示,妊娠相关血浆蛋白A(pregnancyassociated plasma protein A...
由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络,以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用,并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。 他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a novel...
通过调节miRNA的表达起到miRNA海绵的作用.miRNA是一类由长度约22 个核苷酸组成的非编码单链RNA,它参与动,植物转录后基因表达的调控.circRNA-miRNA-mRNA网络是一些疾病的相关调节模式,circRNA可作为miRNA海绵发挥作用,并调节下游相关mRNA.本文中,我们讨论了目前对于circRNA的理解以及通过circRNA-miRNA-mRNA网络在疾病中的...
CircRNA除了直接影响mRNA转录外,还可以通过海绵作用于miRNAs或RNA结合蛋白来调控靶基因的表达。本文将重点介绍CircRNA-miRNA-mRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症中影响基因表达的研究进展。 图片来源:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34853728/ CircRNA的功能 ...
(1)miRNA-circRNA数据库 (2)circRNA参与ceRNA的分析 10:40~12:00 ceRNA分析 ceRNA(竞争性内源RNA)的机制 ceRNA关系对分析 ceRNA网络构建 13:30~15:00 功能富集分析 lncRNA-mRNA共表达分析 miRNA功能分析(GO和pathway富集) lncRNA功能分析(GO和pathway富集) ...
6、circRNA-miRNA-mRNA 调控网络的验证。 福利来啦 2021年1月12日(周二),吉凯基因将进行一场线上直播讲座——环状RNA研究之实验设计及功能验证,拥有6年多项目实操经验的方案设计专家,手把手教你环状RNA研究必备技能。 参与方式见下方海报 参考文献: 1、Kristensen L S,Hansen T B,Venø M T et al....
通过数据库信息,可以预测与 circRNA 互作的蛋白、 mRNA等,鉴定靶基因,验证circRNA-miRNA-mRNA 调控网络系统以及circRNA的表达调控机制。 参考文献: Diallo L H, Tatin F, David F, Godet A C, Zamora A, Prats A C, Garmy-Susini B, Lacazette E. How are circRNAs translated by non-canonical initiation ...