本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布;YTHDF2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的PD-1阻断治疗无反应性;YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防线粒体功能障碍;YTHDF2与IKZF1/3互作促进T细胞多功能性;通过联合使用IKZF1/3抑制剂来那...
本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布;YTHDF2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的PD-1阻断治疗无反应性;YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防线粒体功能障碍;YTHDF2与IKZF1/3互作促进T细胞多功能性;通过联合使用IKZF1/3抑制剂来那...
本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布;YTHDF2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的PD-1阻断治疗无反应性;YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防线粒体功能障碍;YTHDF2与IKZF1/3互作促进T细胞多功能性;通过联合使用IKZF1/3抑制剂来那...
本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布;YTHDF2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的PD-1阻断治疗无反应性;YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防线粒体功能障碍;YTHDF2与IKZF1/3互作促进T细胞多功能性;通过联合使用IKZF1/3抑制剂来那...
(3)YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防T细胞线粒体功能障碍 图3:YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防线粒体应激和T细胞耗竭。 a. 在激活的或Ythdf2CKO CD8 T细胞(抗CD3/CD28,5μg/ml,24小时)中的差异mRNA表达基因火山图(每个基因型2个样本)。显著上调或下调的基因分别用红色或蓝色点表示。在RIP-seq和m6A-seq中富...
2021年11月21日,云序客户上海交通大学医学院附属新华医院张晓玲团队在《Cell Death Disease》以“The m6A “reader” YTHDF1 promotes osteogenesis of bone marrow mesenchymal stem cells through translational control of ZNF839”为题发表论文,通过m6A MeRIP-seq、RIP-seq(云序生物提供)等测序技术揭示了m6A阅读蛋白YT...
在小鼠BMSCs中敲除YTHDF1和在hBMSCs中下调YTHDF1均抑制细胞体外成骨分化。m6A MeRIP-seq、RIP-seq结果显示ZNF839是YTHDF1的靶基因。研究还验证了ZNF839在小鼠中的同源蛋白Zfp839受YTHDF1的m6A依赖性翻译调控。ZNF839通过与Runx2相互作用并增强其转录活性，进一步促进BMSC成骨。研究摘要揭示了m6A阅读蛋白...
联合基因科普rip 原标题:用户文章:RIP-seq和m6A-seq联合分析揭示头颈癌铁代谢机制 | RIP专题 中文标题:YTHDF1增强铁代谢依赖于TFRC m6A甲基化 英文标题:YTHDF1-enhanced iron metabolism depends on TFRC m6A methylation 发表期刊:Theranostics 影响因子:8.579 研究机构:浙江大学医学院附属邵逸夫医院 联川提...查看...
RIP-seq在植物和医学中m6A研究的典型案例 3.1. IGF2BP家族蛋白调控MYC等RNA的稳定性 主要的生化手段:外源性FLAG-RIP LC-MS/MS、内源性IGF2BP-RIP-seq、RNA pulldown 期刊及影响因子:Nature Cell Biology (IF=17.72) 2018, 20(3):285-295 全文解读的链接:RNA m6A阅读蛋白IGF2BP增强mRNA稳定性&促进翻译 |...
m6aViewer: software for the detection, analysis, and visualization of N-6-methyladenosine peaks from m(6)A-seq/ME-RIP sequencing data 来自 万方 喜欢 0 阅读量: 113 作者:Antanaviciute,Agne,Baquero-Perez,Belinda,Watson,M Christopher,Harrison,M Sally,Lascelles,Carolina ...