对长白猪在出生后四个生长期(30天、60天、120天和180天)的骨骼肌样本进行全基因组亚硫酸盐测序(WGBS)和甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq),揭示了5mC和m6A修饰在表观基因组和表观转录组范围内的相关动态和共生,这是猪出生后肌生成进程中5mC/m6A串扰的结果;并鉴定一组在猪出生后骨骼肌生长中由5mC和m6A修饰共...
通过m6A MeRIP-seq、RIP-seq(云序生物提供)等测序技术揭示了m6A阅读蛋白YTHDF1通过调控ZNF839翻译,增强骨髓间充质干细胞BMSC成骨机制,为骨质疏松症的防治提供了新的思路
本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布;YTHDF2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的PD-1阻断治疗无反应性;YTHDF2通过m6A依赖性RNA衰变预防线粒体功能障碍;YTHDF2与IKZF1/3互作促进T细胞多功能性;通过联合使用IKZF1/3抑制剂来那...
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在小鼠BMSCs中敲除YTHDF1和在hBMSCs中下调YTHDF1均抑制细胞体外成骨分化。m6A MeRIP-seq、RIP-seq结果显示ZNF839是YTHDF1的靶基因。研究还验证了ZNF839在小鼠中的同源蛋白Zfp839受YTHDF1的m6A依赖性翻译调控。ZNF839通过与Runx2相互作用并增强其转录活性,进一步促进BMSC成骨。研究摘要揭示了m6A阅读蛋白...
EpiQuik m6A甲基化RNA RIP试剂盒参数说明:CUT&RUN 通过使用靶标特异性一抗(m6A 抗体)和核酸酶分离与富集特异性目的片段。纯化、富集的片段随后使用 PCR 检测和定量,或用下一代测序分析。 详情介绍 中文名称 EpiQuik m6A甲基化RNA RIP试剂盒 英文名字 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit 供应商...
Hypoxic stabilization of RIPOR3 mRNA via METTL3-mediated m6A methylation drives breast cancer progression and metastasisDysregulated N 6 -methyladenosine (m 6 A) modification has been associated with breast cancer pathogenesis. Hypoxia which characterizes solid tumors is known to reprogram the m 6 A ...
五、YTHDF1识别并促进m6A修饰的MAGED1 mRNA的翻译 接下来作者探究了YTHDF1调控MAGED1的机制。作者观察到在患者和小鼠模型中,MAGED1蛋白水平随着促PH因子的作用而升高,但MAGED1基因mRNA却没有显著差异。于是针对YTHDF1作者1) 通过RIP-qPCR发现缺氧诱导PH的小鼠中YTHDF1结合的MAGED1 mRNA更加富集; 2)通过敲降和...
2020年5月11日来自中山大学肿瘤防治中心林东昕院士课题组的郑健博士与中肿生信分析人员左志向博士合作在生物信息的顶级期刊briefingsinbioinformaticsif9101发表了迄今为止第一个最为全面的三类m6a甲基化酶即writerserasers和readers对应靶基因的数据库m6a2target m6A2Target:不做RIP也能预测m6A酶靶基因RIP专题 2020年5月11...
原标题:用户文章:RIP-seq和m6A-seq联合分析揭示头颈癌铁代谢机制 | RIP专题 中文标题:YTHDF1增强铁代谢依赖于TFRC m6A甲基化 英文标题:YTHDF1-enhanced iron metabolism depends on TFRC m6A methylation 发表期刊:Theranostics 影响因子:8.579 研究机构:浙江大学医学院附属邵逸夫医院 联川提...查看全文 ...