对长白猪在出生后四个生长期(30天、60天、120天和180天)的骨骼肌样本进行全基因组亚硫酸盐测序(WGBS)和甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq),揭示了5mC和m6A修饰在表观基因组和表观转录组范围内的相关动态和共生,这是猪出生后肌生成进程中5mC/m6A串扰的结果;并鉴定一组在猪出生后骨骼肌生长中由5mC和m6A修饰共...
通过m6A MeRIP-seq、RIP-seq(云序生物提供)等测序技术揭示了m6A阅读蛋白YTHDF1通过调控ZNF839翻译,增强骨髓间充质干细胞BMSC成骨机制,为骨质疏松症的防治提供了新的思路
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研究摘要揭示了m6A阅读蛋白YTHDF1在BMSCs成骨过程中的重要作用，调控ZNF839翻译以增强成骨能力，对骨质疏松症的防治提供新见解。研究方法包括m6A MeRIP-seq、RIP-seq等测序技术，发表期刊为Cell Death Disease，影响因子为9.2/Q1。研究链接为nature.com的文章页面。文章探讨了m6A阅读蛋白YTHDF1在hBMSCs分...
Hypoxic stabilization of RIPOR3 mRNA via METTL3-mediated m6A methylation drives breast cancer progression and metastasisDysregulated N 6 -methyladenosine (m 6 A) modification has been associated with breast cancer pathogenesis. Hypoxia which characterizes solid tumors is known to reprogram the m 6 A ...
五、YTHDF1识别并促进m6A修饰的MAGED1 mRNA的翻译 接下来作者探究了YTHDF1调控MAGED1的机制。作者观察到在患者和小鼠模型中,MAGED1蛋白水平随着促PH因子的作用而升高,但MAGED1基因mRNA却没有显著差异。于是针对YTHDF1作者1) 通过RIP-qPCR发现缺氧诱导PH的小鼠中YTHDF1结合的MAGED1 mRNA更加富集; 2)通过敲降和...
2020年5月11日来自中山大学肿瘤防治中心林东昕院士课题组的郑健博士与中肿生信分析人员左志向博士合作在生物信息的顶级期刊briefingsinbioinformaticsif9101发表了迄今为止第一个最为全面的三类m6a甲基化酶即writerserasers和readers对应靶基因的数据库m6a2target m6A2Target:不做RIP也能预测m6A酶靶基因RIP专题 2020年5月11...
对于前期已开展m6A测序但是还未开展RIP-seq的老师来说,这个数据库是已知m6A甲基化酶(特殊RNA结合蛋白)对应RIP数据库和下游靶基因最为齐全的之一。当然前期经费不充裕或者想借助他们数据助力自己研究,如引物设计、结合区域预测等需求,也可以充分利用本数据库。
原标题:用户文章:RIP-seq和m6A-seq联合分析揭示头颈癌铁代谢机制 | RIP专题 中文标题:YTHDF1增强铁代谢依赖于TFRC m6A甲基化 英文标题:YTHDF1-enhanced iron metabolism depends on TFRC m6A methylation 发表期刊:Theranostics 影响因子:8.579 研究机构:浙江大学医学院附属邵逸夫医院 联川提...查看全文 ...
d.(i)如果第二测量值高于第一测量值,即所述试验化合物提高nrip1mrna的m6a甲基化的修饰水平,则将所述试验化合物鉴定为对唐氏综合征有用;(ii)如果第二测量值等于或低于第一测量值,即所述试验化合物对nrip1mrna的m6a甲基化修饰水平没有影响或具有降低作用,则将所述化合物鉴定为唐氏综合征不是有用的。