随后,MeRIP-seq/m6A-seq实验方法的建立使得有机会对该修饰的分布和功能进行深入研究[1]。 利用MeRIP-seq/m6A-seq技术鉴定全基因组范围内具有m6A修饰的区域。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围...
RNA甲基化免疫沉淀测序(MeRIP-seq或m6A-seq)是基于m6A高特异性抗体结合高通量测序的技术，可绘制转录组的m6A图谱。该法将m6A残基定位于100~200 nt长的转录组区域，但不能精确到单个碱基，也无法对修饰定量。由m6A-seq衍生的方法在分辨率和定量检测上进行了改进。光交联辅助m6A测序(PA-m6A-Seq)技术是将核糖核苷4-...
利用MeRIP-seq/m6A-seq技术鉴定全基因组范围内具有m6A修饰的区域。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围内对m6A修饰的状况进行系统研究。MeRIP-seq/m6A- seq是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。
因此,在本项研究中,研究人员结合m6A-seq和RNA-seq技术描述了年轻和衰老灵长类动物肝脏、心脏和骨骼肌中与年龄相关的m6A表观转录组动态变化,揭示了m6A修饰与基因表达之间的联系,并发现了在衰老过程中,与心脏和肝脏相比,骨骼肌m6A水平下调最为显著,进一步分析确定了METTL3-m6A-NPNT轴在维持衰老骨骼肌稳态中发挥着潜在...
因此,该研究结合m6A-seq、Ribo-seq和RNA-seq的联用分析手段对强光胁迫下拟南芥转录本的m6A修饰的变化进行了研究,证明了VIR是m6A writer复合物的一员,且在强光条件下维持光合效率方面起着至关重要的作用,揭示了植物在强光胁迫条件下依赖m6A维持光合效率的重要机制。
本研究通过MeRIP-seq等分析表明了m6A甲基化在草莓果实成熟过程中是显著变化。编码序列(CDS)区域中的m6A修饰表现出成熟特异性,并靶向稳定mRNA,而终止密码子周围和3′UTR区域内的m6A修饰通常与相关mRNA丰度呈负相关。研究人员CDS区域鉴定了数千个m6A高甲基化转录本,包括脱落酸(abscisic acid,ABA)生物合成和信号通路中的...
经典的m6A-seq技术可将m6A定位到三碱基至数十碱基的序列窗口内[13, 3, 4, 5]。一些改进方法(比如miCLIP-seq)通过将m6A抗体和其结合的RNA交联,从而在修饰位点附近诱导序列突变或发生截断,可实现近乎单碱基分辨率的检测水平[12, 14]。然而,这些突变或截断类型十分复杂,不同位点之间差异很大,常分散在3~4碱基的序...
暗示靶向ALKBH5和ZNF333可能是一种有效预防和治疗胆汁反流患者胃IM的策略,因此在临床转化中具有重要价值。 原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2162253121002134 本研究中涉及的m6A-seq服务、RNA-seq服务、载体构建服务、siRNA及其NC产品均由锐博生物提供!
利用MeRIP-seq/m6A-seq技术鉴定全基因组范围内具有m6A修饰的区域。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围内对m6A修饰的状况进行系统...
为了定位全转录组水平上的m6A位点,将m6A-seq应用于从人类胃癌细胞系(TMK1)中纯化的RNA,进行大规模平行测序(Fig.6A)。在mTOR、AKT1、PIK3CA和PTEN中都发现存在m6A甲基化的序列特征(Fig.6B)。 在mTOR和PIK3CA中,3‘UTR和相邻区间都存在m6A peaks富集,PTEN存在5‘UTR区域附近的m6A peaks富集(Fig.6C)。AKT1 m6A修饰...