从机制上讲,ALKBH5基因高表达调控LCAT RNA去甲基化并影响LCAT mRNA稳定性。此外,LCAT抑制脂肪前体细胞(preadipocyte)增殖并促进脂肪前体细胞分化,在脂肪形成中发挥关键作用。 重要图形: (1)高脂组和低脂组家禽腹部脂肪组织进行MeRIP-seq分析 (2)mRNA-seq鉴定与脂肪沉积相关的mRNA (3)MeRIP-seq和mRNA-seq联合分析表明...
1、m6A - seq和RNA- seq联合分析锁定靶基因 非酒精性脂肪肝(NAFLD)的特征是过量积累肝细胞中TGs,而肥胖是脂肪肝的主要危险因素,m6A RNA修饰在肥胖相关NAFLD进展中的作用尚未被研究。本文作者利用 m6A-seq分别检测正常肝脏组织(lean)和瘦素受体缺陷型小鼠肝脏组织(db/db)中mRNA m6A甲基化位点,发现在db/db组检测...
从机制上讲,ALKBH5基因高表达调控LCAT RNA去甲基化并影响LCAT mRNA稳定性。此外,LCAT抑制脂肪前体细胞(preadipocyte)增殖并促进脂肪前体细胞分化,在脂肪形成中发挥关键作用。 重要图形 (1)高脂组和低脂组家禽腹部脂肪组织进行MeRIP-seq分析 (2)mRNA-seq鉴定与脂肪沉积相关的mRNA (3)MeRIP-seq和mRNA-seq联合分析表明,...
因此,该研究结合m6A-seq、Ribo-seq和RNA-seq的联用分析手段对强光胁迫下拟南芥转录本的m6A修饰的变化进行了研究,证明了VIR是m6A writer复合物的一员,且在强光条件下维持光合效率方面起着至关重要的作用,揭示了植物在强光胁迫条件下依赖m6A维持光合效率的重要机制。 实验材料 采用强光处理0h和4h的野生型(Col-0)和V...
本研究通过MeRIP-seq分析,研究人员发现在LW和NX猪肌肉中存在差异表达基因,并且这些基因主要富集在蛋白质合成通路中。联合分析MeRIP-seq和RNA-seq数据,鉴定出27个差异表达且m6A修饰基因,其中WFS1基因在LW和NX猪中通过m6A修饰被差异调控。研究人员进一步揭示了m6A修饰通过YTHDF2依赖性方式加速WFS1降解。并识别了一个SNP...
2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据的联合分析 随后研究人员将m6A MeRIP-Seq的数据和先前RNA-Seq的数据进行联合分析，发现163个mRNA，m6A峰和mRNA水平显著改变。41种mRNA的m6A和mRNA水平上调，14种mRNA水平下调。此外，30个基因mRNA表达上调，m6A水平下调，78个基因mRNA表达下调，m6A水平上调(图5A)。最后，构建了一个PPI...
(1)高脂组和低脂组家禽腹部脂肪组织进行MeRIP-seq分析 (2)mRNA-seq鉴定与脂肪沉积相关的mRNA (3)MeRIP-seq和mRNA-seq联合分析表明,LCAT的mRNA甲基化可能调控脂肪沉积。 (4)ALKBH5作为一种去甲基化酶,介导LCAT的降解并影响其稳定性 (5)LCAT抑制脂肪前体细胞增殖 ...
研究首先基于家禽腹部脂肪比例将100日龄雌性三黄鸡分为高脂组和低脂组,并利用MeRIP-seq和RNA-seq技术对两组的腹部脂肪组织进行分析,以鉴定与脂肪形成相关的m6A修饰差异基因。进一步通过细胞实验研究ALKBH5对LCAT mRNA去甲基化及稳定性的影响。本研究揭示了ALKBH5通过去甲基化调控LCAT mRNA稳定性,并影响家禽脂肪形成。
2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据的联合分析 随后研究人员将m6A MeRIP-Seq的数据和先前RNA-Seq的数据进行联合分析,发现163个mRNA,m6A峰和mRNA水平显著改变。41种mRNA的m6A和mRNA水平上调,14种mRNA水平下调。此外,30个基因mRNA表达上调,m6A水平下调,78个基因mRNA表达下调,m6A水平上调(图5A)。最后,构建了一个PPI网络来...