易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基...
作者同时也将m6A-label-seq与miCLIP-seq、m6A-REF-seq、DART-seq等已知测序数据进行了对比,选取了16个特征位点,用独立正交的SELECT【4】m6A鉴定方法验证了这些位点的可靠性。 综上,该研究的测序方法特点如下:(1)利用代谢对甲基化位点的源头标记并直接单碱基分辨率测定,相对于当前的间接方法有更高的准确率;(2)适用...
此外,已经开发出使用与不同样本的RNA连接的条形码适配器的m6A-seq2,用于同时检测不同样本的m6A动态,该方法可以扩展到使用其特异性抗体来检测其他RNA修饰。 尽管基于抗体的方法具有多功能性,但其应用必须依赖于高质量的抗体和大量的起始RNA。基于化学诱导标记的亚硫酸盐测序(BS-seq)以检测m5C RNA修饰(图1b)已被开发...
易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基...
转录组范围内的RNA修饰实验的鉴定主要可以通过三种方法实现，其一是给予特异性结合修饰核苷酸抗体的免疫沉淀方法，比如MeRIP-Seq、m6A-Seq、PA-m6A-Seq、m6A-CLIP/IP、miCLIP、m6A-LAIC-Seq、m6ACE-Seq和m6A-Seq2等；其二是通过基于化合物选择性地与修饰的核糖核苷酸反应的化学方法，比如Pseudo-Seq3以及 AlkAniline-...
(2)RBM33是新的m6A结合蛋白,通过RRM结合m6A RNA转录本,并招募ALKBH5将其去甲基化 内源性RBM33与m6A修饰的RNA底物结合亲和力比与未修饰的RNA寡核苷酸的结合亲和力高;去除RBM33的RRM结构域去除后丧失其与m6A修饰的RNA寡核苷酸结合的能力;RIP-Seq显示近70%的ALKBH5靶基因与RBM33结合。绝大多数RBM33和ALKBH5的共同...
m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; ...
大样本量m6A-QTL性状关联分析,传统MeRIP单个样品价格高,通常难以承担。易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) ...
大样本量m6A-QTL性状关联分析,传统MeRIP单个样品价格高,通常难以承担。易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) ...