易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基...
作者同时也将m6A-label-seq与miCLIP-seq、m6A-REF-seq、DART-seq等已知测序数据进行了对比,选取了16个特征位点,用独立正交的SELECT【4】m6A鉴定方法验证了这些位点的可靠性。 综上,该研究的测序方法特点如下:(1)利用代谢对甲基化位点的源头标记并直接单碱基分辨率测定,相对于当前的间接方法有更高的准确率;(2)适用...
此外,已经开发出使用与不同样本的RNA连接的条形码适配器的m6A-seq2,用于同时检测不同样本的m6A动态,该方法可以扩展到使用其特异性抗体来检测其他RNA修饰。 尽管基于抗体的方法具有多功能性,但其应用必须依赖于高质量的抗体和大量的起始RNA。基于化学诱导标记的亚硫酸盐测序(BS-seq)以检测m5C RNA修饰(图1b)已被开发...
大样本量m6A-QTL性状关联分析,传统MeRIP单个样品价格高,通常难以承担。易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) m6A甲基...
m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; ...
(2)RBM33是新的m6A结合蛋白,通过RRM结合m6A RNA转录本,并招募ALKBH5将其去甲基化 内源性RBM33与m6A修饰的RNA底物结合亲和力比与未修饰的RNA寡核苷酸的结合亲和力高;去除RBM33的RRM结构域去除后丧失其与m6A修饰的RNA寡核苷酸结合的能力;RIP-Seq显示近70%的ALKBH5靶基因与RBM33结合。绝大多数RBM33和ALKBH5的共同...
m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; ...
高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; 重复性高:IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差; ...
本文通过对MeRIP-seq测序数据进行基础分析解析了沙棘组织中m6A修饰的特征,与过往的研究进行比对发掘异同,从而进一步深入分析探究沙棘对于干旱胁迫潜在的调控机制。通过peak及相关基因的富集分析发现沙棘m6A修饰与代谢通路关系密切,进而通过差异甲基化peak与差异基因进行共差异关联分析,将潜在的关键调控因子逐渐缩小范围,从而把视...