通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100 kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据表达量计算相关性以预测lncRNA的靶基因(一般要求样品数超过6个),从而研究lncRNA的功能。 图...
LncRNA-mRNA整合分析(LncRNA芯片数据分析) LncRNA-mRNA整合分析(LncRNA芯片数据分析) 联系购买 配送服务: 运费￥0.00 数量: (库存9999件) 产品详细 LncRNA-mRNA整合分析 1.LncRNA简要 LncRNA是一类转录本长度超过200nt的RNA,它们本身并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后...
包括lncRNA与核染色质结构的连接、表观遗传学过程、增强子功能和生物分子缩合物，以及lncRNA在细胞核外的...
由于lncRNA发现较晚,功能研究不完善,因此,我们可以以mRNA为桥梁对lncRNA的功能进行推断和研究。通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开lncRNA-mRNApearson、spearman相关系数计算页面。左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 http://www.bioinformatics.com.cn/basic_lncrna_mrna_pearson_spearman_coexpression_analysis_t013 ...
lncRNA与mRNA之间的互作关系是通过庞大的蛋白质复合物实现的。在细胞核内,lncRNA可以与转录因子、RNA聚合酶II和mRNA结合,形成一种三维结构,并影响mRNA的转录和剪接过程。一些lncRNA还可以影响mRNA的降解和稳定性,从而调控基因的表达。 2. miRNA介导的调控 miRNA是一类长度约22核苷酸的小分子RNA,它们可以与mRNA的3'非...
随后,进行定量RT-PCR(qRT-PCR),以验证从其他14名受试者(分别为7名ADS患者和7名非退行性腰椎创伤患者)的髓核(NP)组织中随机选择的3种差异表达的mRNA和lncRNA。结果:从RNA-Seq数据中共筛选出1651个上调和1524个下调的mRNA,147个上调和83个下调的lncRNA,构建了共表达网络,进一步研究了它们的调控相互作用。GO基因...
lncRNA是长链非编码RNA,它们不被翻译成蛋白质,而是通过与DNA、RNA或蛋白质相互作用来调控基因表达。 -转录调控:lncRNA可以作为转录因子来调控某些基因的转录活性。它们可以与DNA相互作用并改变某些基因的表达水平。 -转录后调控:lncRNA还可以通过与mRNA相互作用来调控转录后过程,包括可变剪接调控、mRNA稳定性调控和翻译...
长链非编码(lncRNA)RNA测序lncRNA-mRNA共表达Objective To screen differentially expressed lncRNAs in invasive pituitary adenomas by secondgeneration sequencing, and to explore their potential role in the pathogenesis of invasive pituitary adenomas. Methods The expressions of lncRNA and mRNA in 4 patients ...
1．LncRNA简要\x0d\x0aLncRNA是一类转录本长度超过200nt的RNA，它们本身并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。生物体内含量相相当丰富，约占RNA的4-9%（mRNA约占1-2%）。LncRNA的组织特异性及特定的细胞定位，显示lncRNA受到...