lncRNA被任意定义为超过200个核苷酸(200 nt)的非编码转录本，这在生物化学和生物物理RNA纯化协议中是一...
LncRNA:lncRNA名字 mRNA:mRNA名字 r:pearson相关系数 pvalue:p值 flag:+:正相关,-:负相关 6. 过滤结果 下载结果后,使用excel的筛选功能进行过滤,这里以p<0.05,|r|>=0.4的lncRNA-mRNA对绘制共表达网络(带header共28行)。 图9. 相关系数过滤 图10. P值过滤 7,导入cytoscape 拷贝这28行数据,粘贴到一个tx...
预测肝硬化患者肝癌发生的候选lncRNA-miRNA-mRNA网络:综合生物信息学分析 摘要 目的：本研究通过生物信息学分析，探索潜在的竞争性内源性RNA (ceRNA)网络在肝硬化患者HCC发展中的作用。方法：利用GEO和TCGA数据库的数据挖掘，挖掘mRNA、lncRNA和miRNA差异表达谱。在匹配的HCC队列中，RT-PCR证实了他们的表达(n = 6/...
为了深入研究豹纹鳃棘鲈生长差异分化相关lncRNA与mRNA加权基因共表达网络,研究者们采用高通量测序技术对其转录组进行了测序。通过分析测序数据,研究者们鉴定了大量的lncRNA和mRNA分子,并构建了它们的共表达网络。这一网络揭示了lncRNA与mRNA之间的相互作用关系,以及它们在生长差异分化中的角色。 研究发现,在豹纹鳃棘鲈的...
服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图首页 联系我们 留言板 第三代测序服务 代谢组学服务 生物信息学服务 蛋白质组学服务 CRISPR/...
trait loci , eQTL ) 分析与 WGCNA 相结合,收集胃癌RNA-seq 数据及临床信息 数据，利用eQTL 筛选出的相关程度高的lncRNA-mR NA 共表达对,对应的lncRNA 和mRNA 纳入 WGC- NA ,构建共表达网络模块，获得与胃癌分期相关的ln cRNA 并分析其调控关系，为胃癌进展及治疗靶点研 究奠定基础。
lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA调控关系如Sankey图(图7H和图7I)。总共5个lncRNA、6个circRNA、8个miRNA和5个mRNA构成了ceRNA网络(图7J)。 5.关键基因在肝细胞癌中的诊断和预后价值 对ceRNA网络中的关键基因进行ROC曲线分析。结果表明,所有m...
由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络,以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用,并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。 他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a nove...
piRNA是一类新发现的,长度为26-31nt的小RNA分子,通常通过与Argonaute蛋白(如:PIWIL 蛋白亚族)的结合来发挥沉默基因和调控生殖细胞基因组稳定性等作用。piRNA可以与lncRNA通过互补配对的方式结合,其中lncRNAs起到的主要生物学作用包括基因调控激活和抑制。本研究通过聚焦于piR-30188与lncRNA OIP5-AS1的互作调控网络来...
德孚医药出版社在炎症研究期刊发表了最新文章LPS 诱导的急性肺损伤中与焦亡相关的 LncRNA-mRNA 表达谱和 CeRNA 网络综合分析。 内容摘要 目的: 探讨LPS 诱导的急性肺损伤(ALI)基因表达谱中与焦亡相关候选的 lncRNA 和 mRNA 并探讨...