由于lncRNA发现较晚,功能研究不完善,因此,我们可以以mRNA为桥梁对lncRNA的功能进行推断和研究。通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据...
由于lncRNA发现较晚,功能研究不完善,因此,我们可以以mRNA为桥梁对lncRNA的功能进行推断和研究。通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据...
由于lncRNA发现较晚,功能研究不完善,因此,我们可以以mRNA为桥梁对lncRNA的功能进行推断和研究。通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据...
图12. 选择source和target,其中lncRNA为source,mRNA为target 图13. 默认网络图 8. 网络图美化 经过对颜色,节点形状,线型,布局等的简单美化后,获得最终的lncRNA-mRNA共表达网络图(图12)。由于每个人的审美不同,因此这里需要花费大量的时间进行美化,有些研究者还会使用AI等软件给网络图添加背景色等进行进一步优化。
译名:通过lncRNA-mRNA共表达网络分析长非编码RNA调节蝗虫的型变 期刊:Genomics, Proteomics & Bioinformatics IF:7.051(1区) 发表时间:2020.4.14 通讯作者:康乐 通讯作者单位:中科院、河北大学 DOI号:10.1101/2020.04.11.036848 实验设计 在中国河北采集的飞蝗中获得群居型和散居型飞蝗,对其进行散居化和群居化处理。其中...
服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图首页 联系我们 留言板 第三代测序服务 代谢组学服务 生物信息学服务 蛋白质组学服务 CRISPR/...
共表达扰动网络并对网络中的关键基因进行通路富集分析㊂然后，基于乳腺癌相关的ｌｎｃＲＮＡ⁃ｍＲＮＡ关系对，构建乳腺癌预测的分类器模型㊂最后，通过Ｌａｓｓｏ回归筛选变量构建多因素Ｃｏｘ比例风险回归模型对乳腺癌患者进行生存预后分析㊂结果构建了乳腺癌相关的ｌｎｃＲＮＡ⁃ｍＲＮＡ共表达扰动网络，其中...
长链非编码(lncRNA)RNA测序lncRNA-mRNA共表达Objective To screen differentially expressed lncRNAs in invasive pituitary adenomas by secondgeneration sequencing, and to explore their potential role in the pathogenesis of invasive pituitary adenomas. Methods The expressions of lncRNA and m...
内容提示: 侵袭性垂体腺瘤中 lncRNA-mRNA 的共表达网络蒋国庆 1) ,邓兴力 2) ,李晓娟 1) ,钱源 3,4,5)(1)昆明医科大学第一附属医院产科;2)神经外科;3)检验科;4)云南省检验医学重点实验室;5)临床检验诊断云南省创新团队,云南 昆明 650032)[ 摘要 ] 目的 利用二代测序技术筛选侵袭性垂体腺瘤组织中差异...
49 No. 1基于 lncRNA-mRNA 共表达网络的 HBV 相关肝癌生物靶点筛选及综合分析农顺强 1 ,, 2 , 陈晓昊 1 ,, 2 , 许桂丹 2 , 韦武均 2 , 彭彬 ' , 周律 , 邓益斌 ^银( 1. 右江民族医学院附属医院检验科 ,2. 右江民族医学院研究生学院 ,3. 广西肝胆疾病临床医学研究中心 , 广西百色 533000)【...