表达水平分析表明,lncRNA的总体表达水平明显低于mRNA的表达水平(平均值为0.6 vs. 1.9;图1E)。但是,表达特异性分析表明,lncRNA的表达受时间限制的程度要高于mRNA(平均值为0.672对0.436图1F)。基于相对于mRNA的lncRNA基因组位置,蝗虫lncRNA被分类为基因间、重叠区、有义内含子、反义内含子、有义外显子和反义外显...
服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图首页 联系我们 留言板 第三代测序服务 代谢组学服务 生物信息学服务 蛋白质组学服务 CRISPR/...
目的分析先天性小耳畸形患者长链非编码核糖核酸(longnoncodingRNA,lncRNA)和信使核糖核酸(messenger RNA,mRNA)在同一位患者的正常侧耳廓软骨和先天性小耳畸形侧耳廓软骨中的共表达网络,探讨关键lncRNA的作用.方法通过芯片数据差异表达所得出的LncRNAs和mRNAs之间的表达相关性和生物信息学分析,对影响先天性小耳畸形发生的...
差异的肝组织lncRNA,mRNA表达谱, 并构建被DNA元素百科全书数据库(Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE)收录的差异lncRNA-mRNA共表达网络.继而分析共表达网络中的mRNA参与的GO,KEGG; 并分析与核心lncRNA高度相关的mRNA与患者生存曲线的相关性.结果 与5个ENCODE收录的差异lncRNA具有共表达关系的mRNA共有81个(相关...
基于lncRNA-mRNA共表达网络的HBV 相关肝癌生物靶点筛选及综合分析 农顺强1，2,陈晓昊1，2,许桂丹2,韦武均2,彭彬'，周律，邓益斌^银 (1.右江民族医学院附属医院检验科,2.右江民族医学院研究生学院，3.广西肝胆疾病临床医学研究中心，广西百色533000)【摘要】目的对公共基因表达数据库(GEO)中的HBV相关肝癌数据进行...
经过KEEG分析后选取4条信号通路进行LncRNA-mRNA共表达网络分析.结果共筛选出6987个差异表达的LncRNA和7421个差异表达的mRNA.qRT-PCR验证筛选出的10个LncRNA,全部与芯片结果吻合.GO及Pathway显示差异表达的LncRNA和mRNA分别参与凝血,细胞外间隙和蛋白结合等生物学功能.LncRNA-mRNA共表达分析得到了参与p53信号通路,幽门...
显著差异的肝组织lncRNA、mRNA表达谱,并构建被DNA元素百科全书数据库(Encyclopedia of DNA Elements,ENCODE)收录的差异lncRNA-mRNA共表达网络.继而分析共表达网络中的mRNA参与的GO、KEGG;并分析与核心lncRNA高度相关的mRNA与患者生存曲线的相关性.结果 与5个ENCODE收录的差异lncRNA具有共表达关系的mRNA共有81个(相关...
目的探索胆管细胞型肝癌的长链非编码RNA(lncRNA)-信使RNA(mRNA)共表达网络,并对差异表达的lncRNA进行功能分析.方法选取2017年1月—6月在新疆医科大学附属肿瘤医院肝胆外科手术切除的5例胆管细胞型肝癌新鲜组织标本.采用高通量芯片技术对5例胆管细胞型肝癌组织进行mRNA和lncRNA差异表达谱分析,构建lncRNA-mRNA共表达网络...
共表达网络目的通过生物信息学的方法构建先天性巨结肠(Hirschsprung disease,HSCR)调控网络.方法RNA测序检测HSCR组织和正常结肠组织中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA表达谱.结合GSE96854数据库的mRNA表达谱数据,构建lncRNA-mRNA共表达网络.各选择3个lncRNA和mRNA,采用QPCR验证RNA测序结果.结果RNA...
mRNA共表达网络中的mRNA主要参与上皮发育,皮肤发育,表皮细胞分化,角化细胞分化,角化作用等生物学功能和干细胞多能性调节通路,胰腺分泌,视黄醇代谢,轴突导向,细胞外基质-受体相互作用,黏着斑等KEGG信号通路.蛋白质-蛋白质相互作用(protein?protein interaction,PPI)分析中IVL是连接度最大的核心基因,与其共表达的lncRNA ...