取相关性较高的蛋白编码基因进行功能富集分析预测lncRNA的主要功能；当样本数>=25时可采用WGCNA 1.文件输入格式是怎么样的，我题目中的图片所示基因表达矩阵怎么改成输入文件？老师好，我使用的两个数据库（样本量为14），在相关性做的ｌｎｃＲＮＡ－ＭＲＮＡ的互作关系是使用了person相关，但审稿意见建议使用多重相关（multiple comparisons.），请问如何解释呢...
黄喉拟水龟性别调控相关lncRNA和mRNA的筛选及初步分析
探讨LPS 诱导的急性肺损伤(ALI)基因表达谱中与焦亡相关候选的 lncRNA 和 mRNA 并探讨其分子机制。 实验方法: 通过RNA 测序(RNA-Seq),我们分析了脂多糖(LPS)诱导的 ALI 早期的 lncRNA 和 mRNA 表达,利用生物信息学分析获得的差...
此外,基于LASSO-COX预后模型,作者系统地鉴定了与三阴性乳腺癌生存率显著相关的5个lncRNAs和6个mRNAs.免疫相关的11 个lncRNA-mRNA标记可用作独立划分患者总存活时间的预后标记。研究的免疫相关预后信号对15种癌症具有预后意义,并且与20种预后模型相比表现出优异的预测性能,这表明它可能在改善患者的总体存活率方面具有临床...
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相关性分析,输入数据:LncRNAcount矩阵(行为样本,列为基因),mRNA count矩阵 (行为样本,列为基因),本例中分别为lncRNA_expr,hs_relate_mRNA 输入数据的准备 lncRNA_anno[1:4,1:4] #注释后的DElncRNA ##lncRNA 表达矩阵准备 行 样本,列基因 lncRNA_expr <- TCGA_gset[rownames(TCGA_gset)%in%rownames(...