4)boundary:用来设置模拟盒子的边界条件。 5)atom_style:用来定义模拟过程中原子的类型,它会决定原子包括哪些属性。 6)atom_modify:用于修改选定的原子类型的性质。 7)pair_style:定义用于计算原子间作用的势函数。 8)bond_style:定义方法以计算键间作用。 9)angle_style:设置用于计算原子三元组之间的角度相互作用...
atom_style atomic 为设置计算粒子类型,对于普通原子类型选用atomic。需要注意的是,在反应力场计算中,atom_style 选用charge,而units选用full,即反应力场中需要考虑电荷平衡问题 atom_modify map array 表示设置和定义某些存储原子的属性 语法:atom_modify keyword values Keyword :id / map / first id value = yes或...
设置在创建原子或从文件中读取原子之前需要定义的参数。 相关命令:units,dimension,newton,processors,boundary,atom_style,atom_modify. 如果力场参数出现在将要读取的文件中,则这些命令会告诉LAMMPS使用哪种力场:pair_style,bond_style,angle_style,dihedral_style,improper_style。 1.2 原子定义命令 在LAMMPS中定义原子...
group particles type 1 atom_modify first particles group rigid type 1 neigh_modify every 1 delay 0 check yes exclude molecule/intra all #热力学信息输出 thermo 1000 thermo_style custom step atoms ke thermo_modify flush yes lost warn comm_modify vel yes cutoff 3 #创建分子模型 molecule mymol m...
初始化指令:atom_modify, atom_style, boundary, dimension, newton, processors, units 原子定义指令:create_atoms, create_box, lattice, read_data, read_restart, region, replicate 力场指令:angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style, improper_coeff, ...
atom_modify first groupID 允许某一组原子在领域列表是作为第一个原子。 dimension N ,N=2/3 default=dimension 3 设置模拟的维度,进行 2 维模拟前要先使用该命令设置模拟盒子。该命令应在创建晶胞前。 boundary x y z, default=boundary p p p boundary p p f boundary p fs p boundary s f fm 设 ...
在模拟体系定义之前,一些参数必须要被设置.相关的命令有:units,dimension,newton,processors,boundary,atom_style,atom_modify.units:选择单位系统,lammps提供了lj、real、metal三种单位系统 dimension:2d模拟还是3d模拟,默认是3d boundary:边界条件：周期性边界or自由边界 atom_style:定义模拟体系中的原子属性,注意这个style...
p p atom_style atomic timestep 0.001 neighbor 2.0 binneigh_modifydelay 0 every 5 ch...
有些量是通过compute命令计算出来的量,如compute stress/atom命令会计算出每个原子的应力,这个应力就是一个矢量。 矢量可以使用dump命令输出,具体使用方法见: 没有输出,再好的模拟也没用:dump命令4种用法 lammps教程:dump_modify使模拟图像更美观 以上4种命令是lammps模拟中常见的输出命令,灵活使用这几种命令足以满足...
Lammps计算输入文件 # run运行计算 timestep0.003 #时间间隔步 Thermo 200 #每200步输出热动力学统计量 thermo_modify temp new #计算温度通过new指示的方法计算 neigh_modify exclu 7、de type 2 3 #原子2,3之间作用取消(也就是通过不使他们在近邻表中出现实现) Dump 1 all atom 500 dump.crack #每隔500...