lattice在lammps以两种方式被应用,第一种是利用create_atoms命令在模拟框的晶格格点上创建原子,create_atom命令是给晶格格点上的基原子分配不同的原子类型;第二种是被create_box、region、velocity等命令用作距离单位。 lattice命令需要与模拟维度保持一致,style sc or bcc or fcc or hcp or diamond被用作3D问题,而...
简单来说atom style定义了大类,atom type定义了大类中的小类。比如一个水分子中,所有粒子的atom_style都是full,但是在这个style下,又区分为氧原子type和氢原子type。一个模拟中可以由多个type,但是只能有一个style。atom_style定义好后就约束了data文件中具体内容。atom_style的语法是 atom_style <style> #举例:...
1473 -- 10:26 App 【LAMMPS】从零走向进阶:data文件格式 1659 -- 33:13 App 学会这个【LAMMPS】液态水建模,让你的MD模拟突飞猛进 1005 -- 19:41 App MS生成【LAMMPS】可执行文件:简单步骤解析 2445 -- 16:16 App 【LAMMPS】从零走向进阶:in文件基本语法 1264 3 2:11 App 【LAMMPS】周期性边界...
不同atom_style对应的data文件格式不同,下面分别介绍这三种原子类型对应的data文件格式。 1.full类型 full类型的原子类型包含的原子信息如下图所示: full类型对应的原子信息分别为:atom-ID molecule-ID atom-type q x y z nx ny nz,最后1列#C为注释,作用是注释该行原子的类型。 nx、ny、nz为可选项,主要用于...
lammps atom_style翻译尽量使用更加通用的类型虽然这可能会因为某些属性没有用到同时会稍微降低效率但总比出错类型的选择会影响每个原子所能够存储的性质在计算力的时候处理器间能够交换的性质以及在数据文件中所能够显示并被命令readdata读入的性质 使用语法 atom_style style args 其中: style 可取: angle or ...
利用LAMMPS进行分子动力学模拟的主要命令可以分为五类,本文主要介绍了第一类“粒子与盒子建模”命令的使用方法,包括命令:units, atom_style, boundary, lattice, region, create_box, create_atom。 LAMMPS命令分类: 粒子与盒子建模 初始位置与速度 相互作用势函数 ...
lammps atom_style翻译 使用语法 atom_style style args 其中：▪style可取：angle or atomic or body or bond or charge or dipole or electron or ellipsoid or fullor line or meso or molecular or peri or sphere or tri or hybrid ...
atom_style: 定义模拟体系中的原子属性,这一 命令与力场设置的参数中的原子类型(atom type)不 同。 pair_style: 相互作用力场类型,例如范德化势或者硬球势等。 bond_style: 键合相互作用势类型。 angle_style: 键角作用势类型。 dihedral_style: 二面角作用势类型。
lammps atom_style翻译 使用语法atom_style style args其中:style可取:angle?or?atomic?or?body?or?bond?or?charge?or?dipole?or?electron?or?ellipsoid?or?fullor?line?or?meso?or?molecular?or?peri?or?sphere?or?tri?or?hybrid只有body和hybrid需要设置args(具体参考原文档)使用举例atom_style atomicatom_...
atom_style atomic neighbor 0.3 bin neigh_modify delay 5 (2)建模部分 晶格类型为hex类型,因为是二维模型,box在z方向尺寸只有0.5个晶格长度。 box内包含3种类型的原子。 lattice hex 0.7 region box block 0 40 0 10 -0.25 0.25 create_box 3 box ...