举例来说,通过交错地使用create_atoms命令和lattice命令(配置为不同晶向orientations),就可以创建晶界;联合使用create_atoms命令和delete_atoms命令,可以创建非常复杂的体系。 create_atoms命令也可以在已经读入的体系中继续创建原子。在所有列举的这些情况中,都需要注意不要让新创建的原子与已经存在的原子重叠。可以使用del...
lattice在lammps以两种方式被应用,第一种是利用create_atoms命令在模拟框的晶格格点上创建原子,create_atom命令是给晶格格点上的基原子分配不同的原子类型;第二种是被create_box、region、velocity等命令用作距离单位。 lattice命令需要与模拟维度保持一致,style sc or bcc or fcc or hcp or diamond被用作3D问题,而...
create_atoms 1 box create_atoms 3 region regsphere basis 2 3 create_atoms 3 single 0 0 5 1. 2. 该命令用来在晶格阵点上创建原子,或创建一个单独的原子,或创建一些列随机原子。也可以用命令read_data或read_restart通过直接给出原子坐标的方式创建原子。在使用该命令之前,模拟盒子必须是存在的(使用create...
atom_stylefull #创建box regionboxblock-2020-2020-2020unitsbox #box内原子数量、键、角等信息 create_box2boxbond/types1angle/types1extra/bond/per/atom2& extra/special/per/atom2extra/angle/per/atom1 #H2O的晶格,可调节晶格尺寸控制水分子数量或水的密度 latticebcc3.92 #设定区域 regionH2Osphere00018un...
利用LAMMPS进行分子动力学模拟的主要命令可以分为五类,本文主要介绍了第一类“粒子与盒子建模”命令的使用方法,包括命令:units, atom_style, boundary, lattice, region, create_box, create_atom。 LAMMPS命令分类: 粒子与盒子建模 初始位置与速度 相互作用势函数 ...
接下来,使用“atom_style”命令定义原子的类型和属性。然后,使用“boundary”命令定义边界条件。最后,使用“create_atoms”命令创建原子。 势能文件包含了模拟所需的势能参数,用于计算原子之间的相互作用力。常用的势能函数包括Lennard-Jones势和EAM势。势能文件的格式可以根据不同的势能函数来定制。 第二步:定义晶格结构...
–atom_style:用于设置原子模型的类型,比如原子的位置、力场等。–units:用于指定模拟中使用的单位制。–boundary:用于设置模拟系统的边界条件。–region:用于定义模拟系统的区域。–create_box:用于创建模拟系统的盒子。–create_atoms:用于在模拟系统中生成原子。–pair_style:用于选择力场模型。–pair_coeff:用于设置每...
使用lammps的create_atom命令外加关键词var跟set创建形状为三角函数的原子真空边界，可根据某一点坐标确定...
弱弱的问一句，lammps中 read_data create_atom 能一起用吗？ 有没有人这么用过 ...
Atom-style 定义了模拟体系中的原子属性。 Delete-atoms: Pair-style: Pair-style 定义了相互作用力场类型,即势函数。 原子定义 1、 Read-data/read-restart: Read-data 或 read-restart 为从 data 或 restart 文件中读取内容来定义原子。 2、 Lattice: ...