该命令是向已经存在的体系中继续添加原子。换句话说,该命令可以多次使用,从而可以在模拟盒子中创建多组原子。举例来说,通过交错地使用create_atoms命令和lattice命令(配置为不同晶向orientations),就可以创建晶界;联合使用create_atoms命令和delete_atoms命令,可以创建非常复杂的体系。 create_atoms命令也可以在已经读入的...
1. 在盒子box内填充原子 create_atoms type box box类型是最简单的一种用法,在模拟盒子内按照指定的晶格类型填充指定类型的原子,执行这句命令之前需要提前定义box和lattice。 create_atoms 1 box 命令执行结果如下图所示: 2.在指定区域(region)内填充原子 create_atoms type region region-ID 对于复杂结构体系或者...
create_atoms 1 box create_atoms 3 region regsphere basis 2 3 create_atoms 3 single 0 0 5 1. 2. 该命令用来在晶格阵点上创建原子,或创建一个单独的原子,或创建一些列随机原子。也可以用命令read_data或read_restart通过直接给出原子坐标的方式创建原子。在使用该命令之前,模拟盒子必须是存在的(使用create...
他太顺了我只能飞创建的收藏夹默认收藏夹内容:【LAMMPS入门】命令简介 8—create_atoms,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
直接在data file里面说明有13中原子类型，但里面只有前12中原子的坐标，第13种用create_atoms命令创建就...
弛豫时模型变形,我看..弛豫时模型变形,我看见有人说是region和create_atoms命令出问题,尺寸必须是晶格常数的整数倍,并且原子跨出边界后不会重叠,要将create_atoms用参数Box代替region,请问这
create_atoms命令是lammps建模命令中必不可少的一个命令,主要功能是在指定区域内填充一定数量的原子。 create_atoms命令格式为: create_atoms type style args keyword values ... 1. 其中,type指定填充原子的类型,style指定填充原子的方法,lammps提供了box 、region 、single和random 4种填充原子方式。
lammps创建分子的原理是把分子当做一个原子添加到体系中,和添加原子的命令一样,也是create_atoms。 命令语法规则为: create_atoms mol template-ID seed mol:添加分子的关键词 template-ID:分子模板,等同于ms中分子单体 seed:随机数种子,分子取向随机 具体的步骤为: ...
5、 该命令和 molecule命令(分子模板),create_atoms结合,可以建很复杂的模型;比如,水在金晶体表面的行为建模(网易云课堂上有视频讲解) 除了prism类型的region,该命令自动生成为正交盒子。对于非周期边界的处理,在使用该命令时也要小心,所以建议大家使用周期性边界,进行建模,然后利用write_data和dump输出data文件和轨迹...
lammps创建分子的原理是把分子当做一个原子添加到体系中,和添加原子的命令一样,也是create_atoms。 命令语法规则为: create_atomsmoltemplate-IDseed 1. mol:添加分子的关键词 template-ID:分子模板,等同于ms中分子单体 seed:随机数种子,分子取向随机 具体的步骤 ...