3)fix命令包括很多自命令,对体系施加一系列的约束条件,选择系综 4)设定计算:compute,variable 5)边界条件,时间集合,诊断选项。可以使用compute,compute_modify等指定在模拟期间执行各种计算。和可变的命令。Output options are set by the thermo, dump, and restart commands. 6)输出选项 thermo,dump,restart命令设置...
在拉伸过程中,实时输出两个原子z坐标的差值,即可表示为裂纹的扩展宽度。 如果模拟过程提示错误,需要加这句命令: atom_modify map yes 具体的代码为: dimension2boundarysspatom_styleatomicneighbor0.3binneigh_modifydelay5atom_modifymapyeslatticehex0.93regionboxblock0100040-0.250.25create_box5boxcreate_atoms1boxma...
初始化指令:atom_modify, atom_style, boundary, dimension, newton, processors, units 原子定义指令:create_atoms, create_box, lattice, read_data, read_restart, region, replicate 力场指令:angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style, improper_coeff, i...
lammps的输入文件一般分为4个部分Initialization,Atomdefinition,Settings,Runasimulation，后面的两个部分可以按照需要多次重复；(1)Initialization 在你的模拟体系定义之前,一些参数必须要被设置.相关的命令有:units,dimension,newton,processors,boundary,atom_style,atom_modify。其中，units:选择单位系统,lammps提供了lj、...
1.`fix`:用于设置固定粒子组或边界条件的命令。 2.`atom_modify`:用于修改粒子属性,如质量、电荷等。 3.`pair_style`:设置粒子之间的相互作用模型。 4.`run`:执行模拟并更新粒子运动状态。 5.`dump`/`restart`:保存或恢复模拟结果。 五、高级功能 1.粒子相互作用模型:LAMMPS支持多种粒子相互作用模型,如Lenna...
1.1 初始化命令 设置在创建原子或从文件中读取原子之前需要定义的参数。 相关命令:units,dimension,newton,processors,boundary,atom_style,atom_modify. 如果力场参数出现在将要读取的文件中,则这些命令会告诉LAMMPS使用哪种力场:pair_style,bond_style,angle_style,dihedral_style,improper_style。
相关命令: units , dimension , newton , processors , boundary , atom_style , atom_modify . 如果力场参数出现在将要读取的文件中,则这些命令会告诉LAMMPS使用哪种力场: pair_style , bond_style , angle_style , dihedral_style , improper_style 。 在LAMMPS中定义原子的方式有3种。通过 read_data 或 ...
atom_stylesphere atom_modifymaparraysort00 neighbor0.42bin timestep0.0001 #创建盒子 regionregblock0120060085unitsbox create_box1reg #设置原子属性 fixpropallproperty/atommolghostyes #势函数设置 pair_stylegran/hooke/history4e5NULL1e2NULL0.50 pair_coeff** ...
17、omic/bond/charge/dipole/dpd/ellipsoid/full/granular/molecular/hybrid default=atom_style atomic 定义使用什么样的原子类型,决定了原子的属性,该命令应该在其他命令前。 style = angle/atomic/bond/charge/dipole/dpd/ellipsoid/full/granular/molecular/hybrid atom_modify map/first 定义并行计算如何求最近邻 at...
boundary, atom_modify等。 2. Atom definition lammps提供3种定义原子方式: 通过read_data或read_restart命令从data或restart文 件读入,这些文件可以包含分子拓扑结构信息,这 一方法在续算上也很有用。 按照晶格的方式创建原子,这种方式不包含 分子拓扑信息,可能会用到例如如下的一些命令: ...