create_atoms 3 region regsphere basis 2 3 create_atoms 3 single 0 0 5 使用介绍 该命令用来在晶格阵点上创建原子,或创建一个单独的原子,或创建一些列随机原子。也可以用命令read_data或read_restart通过直接给出原子坐标的方式创建原子。在使用该命令之前,模拟盒子必须是存在的(使用create_box命令创建),同时...
1. 在盒子box内填充原子 create_atoms type box box类型是最简单的一种用法,在模拟盒子内按照指定的晶格类型填充指定类型的原子,执行这句命令之前需要提前定义box和lattice。 create_atoms 1 box 命令执行结果如下图所示: 2.在指定区域(region)内填充原子 create_atoms type region region-ID 对于复杂结构体系或者...
而create_box命令则是利用region命令所创建的区域,在该区域内创建盒子 。 8、creat_atoms create_atoms命令是lammps建模命令中必不可少的一个命令,主要功能是在指定区域内填充一定数量的原子。 create_atoms命令格式为: create_atoms type style args keyword values ... 1. 其中,type指定填充原子的类型,style指定...
1. 在盒子box内填充原子 create_atoms type box 1. box类型是最简单的一种用法,在模拟盒子内按照指定的晶格类型填充指定类型的原子,执行这句命令之前需要提前定义box和lattice。 create_atoms 1box 1. 命令执行结果如下图所示: 2.在指定区域(region)内填充原子 create_atoms type region region-ID 1. 对于复杂...
具体来说,可以使用"create_atoms"命令来在指定区域内填充一定数量的原子,这是LAMMPS建模命令中必不可少的一个命令。例如,要在一个二维晶格中插入一个硅原子,可以使用以下命令: ```bash create_atoms 2 box linear 2 1 0.0 0.0 0.0 create_atoms 1 box linear 2 1 0.5 0.5 0.0 ``` 在这个例子中,"box ...
1. atom_style命令: 设置模拟中原子的类型和属性。 例如: atom_style atomic 2. lattice命令: 定义晶格结构(如果使用周期性边界条件)。 例如: lattice fcc 3.52 3. create_atoms命令: 创建原子,包括原子类型、位置等。 例如: create_atoms 1 box
在本例中，有两种晶格（Ni和石墨烯），所以用到两次lattice命令，需要注意的是，每次使用create_atoms命令填充原子之前，要确定最近的lattice命令是不是即将要填充的原子。大家可以测试以下两段代码，看看r1，r2内的晶格原子是否相同？#代码1：（1）lattice fcc 3.52（2）region r1 block 0 10 0 10 0 10...
在LAMMPS中定义原子的方式有3种。通过read_data或read_restart命令从数据中读取它们或重新启动文件。这些文件可以包含分子拓扑信息。或使用以下命令在没有分子拓扑的晶格上创建原子:lattice,region,create_box,create_atoms。使用replicate命令可以复制整个原子集以进行更大的模拟 。
以下是一些常用的LAMMPS命令和选项: –atom_style:用于设置原子模型的类型,比如原子的位置、力场等。–units:用于指定模拟中使用的单位制。–boundary:用于设置模拟系统的边界条件。–region:用于定义模拟系统的区域。–create_box:用于创建模拟系统的盒子。–create_atoms:用于在模拟系统中生成原子。–pair_style:用于...
create_atoms:在模拟盒子中创建原子。 当然,创建模型不仅限于这些命令,还有一些其他的命令,比如delete_atoms等。事实上,我看到有些大牛仅仅使用LAMMPS的内置命令,就建立了很复杂的模型。 下面简单举一例:构建6x6x6的FCC-Cu的晶胞。 输入脚本:in.fcc-Cu # model of FCC-Cu, 6x6x6 boundary p p p units metal...