如果你的模拟盒子是周期性的,你应该确保其尺寸是晶格距离的整数倍,从而避免在盒子边界处可能存在的原子重叠。如果你的盒子是周期性的,并且在某个方向上盒子的尺寸是晶格距离的整数倍,那么LAMMPS会在边界上只放置一个原子(译注:边界上的原子不会丢失或在两个面同时出现)。 region类型:该命令会在region-ID所指定的区...
lammps教程:create_atoms命令详解 create_atoms命令是lammps建模命令中必不可少的一个命令,主要功能是在指定区域内填充一定数量的原子。 create_atoms命令格式为: create_atoms type style args keyword values ... 其中,type指定填充原子的类型,style指定填充原子的方法,lammps提供了box 、region 、single和random 4种...
lammps教程:create_atoms生成原子的4种方式 create_atoms命令是lammps建模命令中必不可少的一个命令,主要功能是在指定区域内填充一定数量的原子。 create_atoms命令格式为: create_atoms type style args keyword values ... 1. 其中,type指定填充原子的类型,style指定填充原子的方法,lammps提供了box 、region 、singl...
如果你的模拟盒子是周期性的,你应该确保其尺寸是晶格距离的整数倍,从而避免在盒子边界处可能存在的原子重叠。如果你的盒子是周期性的,并且在某个方向上盒子的尺寸是晶格距离的整数倍,那么LAMMPS会在边界上只放置一个原子(译注:边界上的原子不会丢失或在两个面同时出现)。 region类型:该命令会在region-ID所指定的区...
【LAMMPS入门】命令简介 3—boundary 半纸AI 01:59 【LAMMPS入门】利用OVITO进行位错分析/DXA分析 半纸AI 83560 mimic-nhanes-孟德尔随机化-数据库联合分析-思路复现 决策链DecisionLinnc 02:41 够自私,才能当学霸 教你自学的郭学长 1.6万12 LAMMPS建模——Al的单轴拉伸 ...
lammps cre..我知道type指的是atom type,并且用1到N表示,但我想问1到N的数字分别对应什么atom type???有大神可解答吗???
求教各位大神，有没有用lammps做层层自组装的？怎样用creat_atoms命令来添加分子？谢谢了！
弛豫时模型变形,我看..弛豫时模型变形,我看见有人说是region和create_atoms命令出问题,尺寸必须是晶格常数的整数倍,并且原子跨出边界后不会重叠,要将create_atoms用参数Box代替region,请问这
已经解决了，直接在data file里面说明有13中原子类型，但里面只有前12中原子的坐标，第13种用create_...
lammps创建分子的原理是把分子当做一个原子添加到体系中,和添加原子的命令一样,也是create_atoms。 命令语法规则为: create_atoms mol template-ID seed mol:添加分子的关键词 template-ID:分子模板,等同于ms中分子单体 seed:随机数种子,分子取向随机 具体的步骤为: ...