4)boundary:用来设置模拟盒子的边界条件。 5)atom_style:用来定义模拟过程中原子的类型,它会决定原子包括哪些属性。 6)atom_modify:用于修改选定的原子类型的性质。 7)pair_style:定义用于计算原子间作用的势函数。 8)bond_style:定义方法以计算键间作用。 9)angle_style:设置用于计算原子三元组之间的角度相互作用...
neigh_modify every 1 delay 0 check yes 以上都是计算设置,每个模拟这些设置都大同小异。下面开始就是针对模拟对象的设置。 第六条命令设置原子类型,即atom_style命令。我们模拟的基本构成是原子。不同的对象粒子所具有的属性是不同的。对于某个对象,粒子不需要的属性就不需要设置,以节省内存加速计算。比如研究对象...
初始化指令:atom_modify, atom_style, boundary, dimension, newton, processors, units 原子定义指令:create_atoms, create_box, lattice, read_data, read_restart, region, replicate 力场指令:angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style, improper_coeff, i...
初始化指令:atom_modify, atom_style, boundary, dimension, newton, processors, units 原子定义指令:create_atoms, create_box, lattice, read_data, read_restart, region, replicate 力场指令:angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style, improper_coeff, ...
有些量是通过compute命令计算出来的量,如compute stress/atom命令会计算出每个原子的应力,这个应力就是一个矢量。 矢量可以使用dump命令输出,具体使用方法见: 没有输出,再好的模拟也没用:dump命令4种用法 lammps教程:dump_modify使模拟图像更美观 以上4种命令是lammps模拟中常见的输出命令,灵活使用这几种命令足以满足...
在模拟体系定义之前,一些参数必须要被设置.相关的命令有:units,dimension,newton,processors,boundary,atom_style,atom_modify.units:选择单位系统,lammps提供了lj、real、metal三种单位系统 dimension:2d模拟还是3d模拟,默认是3d boundary:边界条件：周期性边界or自由边界 atom_style:定义模拟体系中的原子属性,注意这个style...
atom_modify first particles group rigid type 1 neigh_modify every 1 delay 0 check yes exclude molecule/intra all #热力学信息输出 thermo 1000 thermo_style custom step atoms ke thermo_modify flush yes lost warn comm_modify vel yes cutoff 3 ...
atom_modify first groupID 允许某一组原子在领域列表是作为第一个原子。 dimension N ,N=2/3 default=dimension 3 设置模拟的维度,进行 2 维模拟前要先使用该命令设置模拟盒子。该命令应在创建晶胞前。 boundary x y z, default=boundary p p p boundary p p f boundary p fs p boundary s f fm 设 ...
当出现丢失原子错误提示时，添加thermo_modify lost ignore 命令可以关掉错误提示，使程序能够运行下去。但...
atom_style atomic timestep0.001 neighbor2.0bin neigh_modify delay0every5check yes #创建Al板结构 lattice fcc4.05 region box block05020020 create_box3box create_atoms1region box #划分上下两个区域 region left block INF INF INF INF2INF region right block INF INF INF INF18INF ...