Flow Cell binding Regin:与flowcell表面引物互补序列,对应图中的P5、P7 Index:识别不同样本,从而使得多样本可以在一个flowcell中同时测序 Sequencing binding site:边合成边测序时的引物结合序列,图中的Rd1 SP和Rd2 SP(sequencing primer)是为了双端测序而设计 进一步纯化文库,去除多余的接头和未发生连接的DNA片段 ...
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测序引物锚定在序列模板上,正好与模板的Rd2 SP (SP: sequence primer测序引物)完全互补配对,随后开始边合成边测序,所以测序reads 5'端的接头和引物序列都不会被测到,直接跳过。测序的第一个碱基是插入片段的第一个碱基。依次继续测。 假如测序读长小于插入片段大小,那么插入片段部分都没有测通,另一端的Rd1 SP...
(oligos,P7 和P5接) 介1000条DNA模板的拷35个循的式PCRDNA 模板cBotHiSeqSequence rr cBot 工作流程DNA文 性:使用 NaOH将双DNA文模板 :将DNA模板交到Flow Cell 上第一合成: 以Flow Cell 表面上的oligos引物,合成第一冲走DNA模板,以合成的第一模板行 35循的式式PCR :PCR性化:将与P5接接的 DNAFlow Cell...
WorkflowB A dual-indexed sequencing run ontheMiniSeq, NextSeq, HiSeq 4000, or HiSeq3000 performs theIndex 2Re 26、ad afterthe Read2resynthesis step. This workflow requires a reversecomplement of theIndex 2(i5)primer sequencecompared to theprimer sequence usedonother Illumina platforms. TheIndex2...
本制品是专门针对于illimina高通量测序平台所开发的DNA接头。可用于illimina高通量测序平台下DNA和RNA文库的构建。试剂盒分为12种接头和24种接头两种形式,每种接头均含有*的6碱基index序列(barcode),以便于在多样品混合测序时进行不同样品的区分。 本制品提供的接头浓度为30μM,操作时的用法随着建库所用试剂盒、初始...
我涂红色部分就是index序列的反向反义序列,每个index序列是不同的8个碱基,这个和Nextera的i7(部分一样,请自己对照)是一样的。i5 sequence: ATAC-seq的Adaptor1 里没有barcode i7 sequence:有两种Adaptors,分别为Adaptor1 (50bp) 和Adaptor2 (53bp)。其中Adaptor1(5’ illumina Primer1 ...
Illumina测序介绍 Illumina测序技术概述 ?2013Illumina,Inc.Allrightsreserved.Illumina,IlluminaDx,BaseSpace,BeadArray,BeadXpress,cBot,CSPro,DASL,DesignStudio,Eco,GAIIx,GeneticEnergy,GenomeAnalyzer,GenomeStudio,GoldenGate,HiScan,HiSeq,Infinium,iSelect,MiSeq,Nextera,NuPCR,SeqMonitor,Solexa,TruSeq,TruSight,Vera...
u Dual-indexedlibraries—Addsupto24unique8-baseIndex1(i7)sequencesandupto16unique8-base Index2(i5)sequencestogenerateupto384uniquelytaggedlibraries. Duringindexedsequencing,theindexissequencedinaseparateread,calledtheIndexRead,whereanew sequencingprimerisannealed.Whenlibrariesaredual-indexed,thesequencingrun...
2. Index测序:所有循环结束后,read products 被洗掉,index1 primer与链上index primer1 结合位点杂交配对,进行index1的合成及检测 3. Index1测序完成后,洗脱测序产物。此时机器已通过荧光得到了index1的序列 4.Index2测序:Forward strand顶端的P5序列与Flowcell上的P5’杂交配对,进行index2测序。测序完成后洗脱产物...