首先read1的测序引物结合到read1 sequencing primer处,启动测序,在流动槽中加入DNA聚合酶和可逆终止荧光dNTP(保证链延长时只结合一个dNTP),在read1的测序引物的3'端开始复制。一个碱基加入后会发出特征荧光信号,通过激光扫描,我们就能判断它是哪个碱基,从而推断原来模板链上的碱基是哪种。 当一个dNTP和模板链互补时...
Read 1 sequencing primer:5'-ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3' Read 2 sequencing primer:5'-GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT-3' trueseq文库存在接头污染时: Forward filter:AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC Reverse filter:AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT illumina:nextera文库结构 Tn5 adapter...
4、Paired-end sequencing(即对Reverse strand测序) (1)洗脱index2测序产物后,以Flow cell上的P5’为引物,Forward strand为模板进行桥式扩增,得到双链 (2)NAOH使双链变性为单链,并洗去已经测序完成的Forward strand (3)类似的,read primer2结合到靠近P7’的read primer bi...
Illumina sequencing and array technologies drive advances in life science research, translational and consumer genomics, and molecular diagnostics.
四、Paried-end sequencing(即对Reverse strand测序) 1. 洗脱index2测序产物后,以Flowcell上的P5’为引物,Forward strand为模板进行桥式扩增,得到双链 2. NAOH使双链变性为单链,并洗去已经测序完成的Forward strand 3. 类似的,readprimer2结合到靠近P7’的read primer binding site 2开始对Reverse strand的测序。
测序从第一个测序引物primer的延伸开始,生成第一个read(读段)。每一个核苷酸都带有荧光标记。四种核苷酸带有四个不同的荧光标记,发射出特征性的荧光信号,这个专有过程叫sequencing-by-synthesis.循环结束后,生成的read product被冲掉,在生成下一个read。整个过程生成数百万个reads,代表所有的fragment。
TruePrepTMDual Index Sequencing Primer Box for Illumina®是TruePrepTMDNA Library Prep Kit for Illumina®专用测序引物试剂盒。试剂盒分为两种规格:TD301为单端测序专用测序引物试剂盒,包含Read 1测序引物R1、Index 1测序引物IX1以及Index 2测序引物IX2;TD302为双端测序专用测序引物试剂盒,包含Read 1测序引物R1...
目前我们主要分析的数据还是二代测序的数据,也就是大家经常挂在嘴边的NGS,而这其中最大的赢家应该算是illumina测序公司了,其经典的边合成边测序(sequencing by synthesis,SBS)巧妙地利用带不同荧光的dNTP来让碱基组成可视化,本身还是很有意思的。但随之而来的就有一些问题,比如以RNA-seq为例,如果你是一个经典的从表...
四、Paried-end sequencing(即对Reverse strand测序) 1. 洗脱index2测序产物后,以Flowcell上的P5’为引物,Forward strand为模板进行桥式扩增,得到双链 2. NAOH使双链变性为单链,并洗去已经测序完成的Forward strand 3. 类似的,readprimer2结合到靠近P7’的read primer binding site 2开始对Reverse strand的测序。
测序从第一个测序引物primer的延伸开始,生成第一个read(读段)。每一个核苷酸都带有荧光标记。四种核苷酸带有四个不同的荧光标记,发射出特征性的荧光信号,这个专有过程叫sequencing-by-synthesis.循环结束后,生成的read product被冲掉,在生成下一个read。整个过程生成数百万个reads,代表所有的fragment。