在确认MCTC HCC免疫细胞的浸润情况后，作者对TME中的细胞进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq），发现MCTC HCC中存在一种特殊的巨噬细胞表型。这种表型与脂质相关（LA -TAM）、免疫调节（Reg -TAM）和促血管生成（Angio-TAM）表型表现出相关的特征，这些巨噬细胞通过促进免疫逃避、提供营养和满足癌细胞的代谢需求参与肿瘤...
在确认MCTC HCC免疫细胞的浸润情况后,作者对TME中的细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),发现MCTC HCC中存在一种特殊的巨噬细胞表型。这种表型与脂质相关(LA -TAM)、免疫调节(Reg -TAM)和促血管生成(Angio-TAM)表型表现出相关的特征,这些巨噬细胞通过促进免疫逃避、提供营养和满足癌细胞的代谢需求参与肿瘤的发生。
然后,作者在治疗无效患者的每个空间簇中对scRNA-seq数据集中具有CAFs和SPP1+巨噬细胞特征的点进行比较,发现SPP1+巨噬细胞和CAFs共定位在一簇,SPP1+巨噬细胞和CAFs的特征评分在ST数据集显示出正相关性。这些结果表明SPP1+巨噬细胞和CAFs可能在TIB结构中发生物理相互作用。 此外,作者还发现在SPP1+巨噬细胞/CAFs簇...
为了表征TEX细胞在不同抗PD -1反应中的作用,研究人员从7例患者的scRNA-seq数据中提取了T细胞的信息。根据TEX细胞在敏感组和耐药组的分布,将TEX细胞分为三个亚群:TEX Sensitive (TEXS,主要分布在敏感组)细胞、TEX Resistant (TEXR,主要分布在耐药组)细胞和TEXS&R(均匀分布在两组)细胞。对TEXR细胞和TEXS细胞...
活检样本的scRNA-seq显示,无反应者中化疗耐药和免疫逃逸特征富集,而反应者表现出更高的免疫细胞浸润和更强的免疫-恶性细胞相互作用。 对PBMCs的动态scRNA-seq表明,治疗后T细胞亚群扩增,细胞毒性相关基因(如GZMB、GNLY和IFNG)和增殖标志物(MKI67)表达增加,且在反应者中更为显著。这伴随着反应者中非...
scRNA-seq,ST,免疫组化 研究结果 1.空间转录组测序揭示了与免疫治疗效果相关的TIB微环境结构 对8名抗PD-1治疗的HCC患者的肿瘤切片(无应答者,n=5;应答者,n=3)和相邻正常组织切片(n=3)进行了空间转录组测序(10x Genomics)。基于无偏聚类和spots特征,将肿瘤spots分为肝细胞、免疫/成纤维细胞、肌成纤维细胞/...
然后,作者在治疗无效患者的每个空间簇中对scRNA-seq数据集中具有CAFs和SPP1+巨噬细胞特征的点进行比较,发现SPP1+巨噬细胞和CAFs共定位在一簇,SPP1+巨噬细胞和CAFs的特征评分在ST数据集显示出正相关性。这些结果表明SPP1+巨噬细胞和CAFs可能在TIB结构中发生物理相互作用。
尽管单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了关于CAF多样性的重要信息,但空间技术的出现彻底改变了TME领域,并更直观地揭示了多种组分的协调机制。在很多癌症类型中已经探索了CAFs与其他细胞的接近性;然而,某些CAF表型的精确空间邻域以及通过这种空间关...
主要技术:scRNA-seq,ST,免疫组化 导语 肝细胞癌(HCC)是肝癌中最常见的组织学亚型,也是导致癌症相关死亡的第三大原因。免疫检查点阻断(ICB)治疗的革命性进展,如抗PD-1/L1和抗CTLA4抗体,延长了多种癌症患者的生存期。以前的大多数研究都集中在不同细胞成分在TME中与免疫疗法疗效相关的作用。但是TIB的具体结构TME...
然后,作者在治疗无效患者的每个空间簇中对scRNA-seq数据集中具有CAFs和SPP1+巨噬细胞特征的点进行比较,发现SPP1+巨噬细胞和CAFs共定位在一簇,SPP1+巨噬细胞和CAFs的特征评分在ST数据集显示出正相关性。这些结果表明SPP1+巨噬细胞和CAFs可能在TIB结构中发生物理相互作用。