2024年5月，天津医科大学于津浦和李祥春作为共同通讯作者在《Cell Reports Medicine》（IF=14.3）上发表了题为“Macrophagecoated tumor cluster aggravates hepatoma invasion and immunotherapy resistance via generating local immune deprivation”的研究论文。据研究表明肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在HCC的TME中普遍存在，且促...
然后,作者在治疗无效患者的每个空间簇中对scRNA-seq数据集中具有CAFs和SPP1+巨噬细胞特征的点进行比较,发现SPP1+巨噬细胞和CAFs共定位在一簇,SPP1+巨噬细胞和CAFs的特征评分在ST数据集显示出正相关性。这些结果表明SPP1+巨噬细胞和CAFs可能在TIB结构中发生物理相互作用。 此外,作者还发现在SPP1+巨噬细胞/CAFs簇...
CIBERSORTx反卷积分析显示,TCGA-LIHC数据中肿瘤样本中CAFs的浸润比例显著高于邻近的正常组织,并且CAFs浸润程度较高的患者总体生存期较短,揭示了CAFs在肿瘤组织中的富集可能与HCC患者预后不良有关。然后,作者在治疗无效患者的每个空间簇中对scRNA-seq数据集中具有CAFs和SPP1+巨噬细胞特征的点进行比较,发现SPP1+巨噬细胞...
4. MCTC HCC中的巨噬细胞表现出明显的免疫抑制和促肿瘤表型 在确认MCTC HCC免疫细胞的浸润情况后,作者对TME中的细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),发现MCTC HCC中存在一种特殊的巨噬细胞表型。这种表型与脂质相关(LA -TAM)、免疫调节(Reg -TAM)和促血管生成(Angio-TAM)表型表现出相关的特征,这些巨噬细胞通过...
接下来,作者执行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)来探索MMP9重塑肿瘤免疫微环境(TIME)的机制。使用荧光激活细胞分选(FACS)技术从MMP9F/F和MMP9Δhep小鼠的CTNNB1GOF HCC组织中分离出肿瘤CD45+细胞。对所有CD45+细胞群体进行无监督均匀流形近似和投影(UMAP)分析,鉴定出23个子簇(图6A)。鉴定出的免疫细胞群体包括T细胞...
E/F: 根据scRNA-seq数据,用CAF top20的基因作为基因集,对每个spot进行打分,发现在SPP1/CAF中显著高; G/H: 根据scRNA-seq数据,用SPP1+Macrophage top20的基因作为基因集,对每个spot进行打分,,发现在SPP1/CAF中显著高; L: 病人1的ST数据中,CAF和SPP1+Macrophage 对应的spots中,CAF和SPP1+Macrophage得分的相...
然后,作者在治疗无效患者的每个空间簇中对scRNA-seq数据集中具有CAFs和SPP1+巨噬细胞特征的点进行比较,发现SPP1+巨噬细胞和CAFs共定位在一簇,SPP1+巨噬细胞和CAFs的特征评分在ST数据集显示出正相关性。这些结果表明SPP1+巨噬细胞和CAFs可能在TIB结构中发生物理相互作用。
scRNA-seq,ST,免疫组化 研究结果 1.空间转录组测序揭示了与免疫治疗效果相关的TIB微环境结构 对8名抗PD-1治疗的HCC患者的肿瘤切片(无应答者,n=5;应答者,n=3)和相邻正常组织切片(n=3)进行了空间转录组测序(10x Genomics)。基于无偏聚类和spots特征,将肿瘤spots分为肝细胞、免疫/成纤维细胞、肌成纤维细胞/...
主要技术:scRNA-seq,ST,免疫组化 导语 肝细胞癌(HCC)是肝癌中最常见的组织学亚型,也是导致癌症相关死亡的第三大原因。免疫检查点阻断(ICB)治疗的革命性进展,如抗PD-1/L1和抗CTLA4抗体,延长了多种癌症患者的生存期。以前的大多数研究都集中在不同细胞成分在TME中与免疫疗法疗效相关的作用。但是TIB的具体结构TME...
scRNA-Seq: Single-cell RNA sequencing TACE: Transarterial chemoembolization TCGA: The Cancer Genome Atlas TERC: Telomerase RNA component TERT: Telomerase reverse transcriptase TF: Transcription factor TOP2A: Topoisomerase 2 𝛼 JAKs: Transmembrane receptor Janus kinases References Bray F, Ferla...