CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagment)作为一种新兴的DNA蛋白互作研究技术,凭借其信噪比高,可重复性好,实验周期更快等优势,在植物以及动物细胞中的成功应用与科研文章的发表[1-2],受到广大科研工作者的信赖。 CUT&Tag是蛋白质与DNA互作研究的革新技术,其核心技术为pA/G-Tn5 Transposase,将Protein A/G与...
1. Kaya-Okur H S, Wu S J, Codomo C A, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 1930. 2. Buenrostro J D, Giresi P G, Zaba L C, et al. Transposition of native chromatin for fast and sensitive ...
1. G4-CUT&Tag技术的信噪比及分辨率高于ChIP-seq技术 与G4 ChIP-seq相比,G4-CUT&Tag在启动子区域产生的信号更高,背景信号更少(图2)分辨率更高(图3)图2 G4-CUT&Tag数据背景信号低 图3 G4-CUT&Tag分辨率高 2. G4-CUT&Tag技术生物学重复性高 生物学重复之间的高度相关性说明G4-CUT&Tag的再现性...
一、CUT&Tag技术介绍 CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是替换传统ChIP-seq技术来研究与目标蛋白质互作DNA的新技术。与ChIP-seq相同的是都需要利用抗体识别并结合目标蛋白,不同点在于CUT&Tag技术是利用Tn5转座酶与Protein A/G的融合蛋白,通过二抗把Tn5酶复合体引导至目标染色质区域,Tn5转座酶在剪...
下面以三篇CUT&Tag应用文章为例,具体说明应用CUT&Tag解析目的蛋白在基因表达调控机制的研究思路。01LSD1在调控卵泡颗粒细胞发育以及卵泡成熟过程中的作用机制● 文章题目:LSD1 promotes the FSH responsive follicle formation by regulating autophagy and repressing Wt1 in the granulosa cells● 期刊:Science bulletin...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种专注于DNA-蛋白互作研究的革新性工具,主要用于识别转录因子或组蛋白修饰在全基~因组范围内的结合位点。CUT&Tag分析利用酶切与转座酶标记技术,精准定位转录因子或组蛋白修饰在基~因组中的结合位点,助力研究DNA-蛋白互作机制,为基~因组和表观遗传学研究...
CUT&Tag技术服务 CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种研究组蛋白修饰和转录因子基因组定位的方法,可以用于揭示蛋白质与DNA之间的相互作用或鉴定目标蛋白质的DNA结合位点。 CUT&Tag最大的优势是需要的起始材料少,适合对样品量不能满足开展ChIP-Seq的样品类型进行组蛋白修饰和转录因子结合位点分析,...
研究人员通过CUT&Tag技术鉴定内皮细胞中H3K9la调控的下游基因。结果发现,实验组和对照组差异peaks的GO和KEGG通路分析表明,H3K9la上调的结合位点相关基因(NECTIN1、TGFBR2、ABL1、PTGFR等)在细胞增殖、细胞迁移、粘附连接和血管生成等与新生血管形成相关的途径中富集。在VEGF刺激下,这些候选基因的启动子区域H3K9la水平...
但是近年来CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagment)作为一种新兴的DNA蛋白互作研究技术,凭借其信噪比高,可重复性好,实验周期更快等优势,在植物以及动物细胞中的成功应用,相关科研成果也陆续发表[1-2],受到广大科研工作者的信赖。 Part II DNA蛋白质互作研究进展 2009年,Dominic Schmidt等将ChIp与当时热门技术...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种专注于DNA-蛋白互作研究的革新性工具,主要用于识别转录因子或组蛋白修饰在全基~因组范围内的结合位点。CUT&Tag分析利用酶切与转座酶标记技术,精准定位转录因子或组蛋白修饰在基~因组中的结合位点,助力研究DNA-蛋白互作机制,为基~因组和表观遗传学研究提供精准...