2021年4月,华中农业大学李兴旺课题组将CUT&Tag技术应用于单子叶植物水稻和双子叶植物油菜籽上,新鲜或交联组织都可提核后进行CUT&Tag实验,可以使用低至 0.01g植物组织作为起始材料,一天即可完成实验,相关研究成果以“Rapid and Low-Inp...
在 CUT&Tag 中,先把细胞或细胞核透化处理,然后加入针对特定染色质蛋白的抗体,再让带着镶嵌末端接头的 pA-Tn5 附着到抗体结合的地方。接着,通过添加镁离子激活转座酶,把接头插入附近的 DNA 上,最后扩增这些接头来构建测序文库。这种基于抗体锚定 Tn5 的方法灵敏度很高,因为样本在 pA-Tn5 附着后会经过严格清洗,...
新鲜或交联组织都可提核后进行CUT&Tag实验,可以使用低至0.01g植物组织作为起始材料,一天即可完成实验,相关研究成果以“Rapid and Low-Input Profiling of Histone Marks in Plants Using Nucleus CUT&Tag”为题发表在Frontiers in Plant Science上。
CUT&Tag 简介 在真核细胞的核里,DNA 上发生的所有动态活动,比如基因表达调控,都离不开一个由核小体(包括它们的化学修饰)、转录因子和相关蛋白复合物组成的染色质环境。不同的染色质特征会标记出激活或抑制基因表达的调控区域,以及那些在细胞类型间有差异、在发育过程中会变化的染色质区域。 过去,科学家们通常用...
图 CUT&Tag用于组蛋白修饰分析和RNAPII（Kaya-Okur et al., 2019）。参考文献 Ye Zheng, Kami Ahmad, Steven Henikoff. CUT&Tag Data Processing and Analysis Tutorial. Protocol .io, 2020.Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and ...
CUT&Tag分析服务 品牌百泰派克 产地北京 型号cuttag-analysis-service 面议 咨询 CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)主要用于研究特定蛋白质与基因组DNA的相互作用。与传统的ChIP-Seq技术相比,CUT&Tag具有更高的信噪比、更少的样本需求和更简单的操作流程,使其在基因调控机制、细胞分化研究以及疾病标志物...
2019年,Steven Henikoff团队使用pA-Tn5替代pA-MNase,推出了CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术。其原理与CUT&RUN类似,首先通过刀豆蛋白A包被的磁珠(ConA beads)吸附细胞(与细胞膜上的糖蛋白结合),通过洋地黄皂苷在细胞膜上“打孔”,在抗体引导下,转座酶精准靶向目的蛋白。与MNase不同的是,转座酶...
2021年4月,华中农业大学李兴旺课题组将CUT&Tag技术应用于单子叶植物水稻和双子叶植物油菜籽上,新鲜或交联组织都可提核后进行CUT&Tag实验,可以使用低至0.01g植物组织作为起始材料,一天即可完成实验,相关研究成果以“Rapid and Low-Input Profiling of Histone Marks in Plants Using Nucleus CUT&Tag”为题发表在...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种专注于DNA-蛋白互作研究的革新性工具,主要用于识别转录因子或组蛋白修饰在全基因组范围内的结合位点。CUT&Tag分析服务利用酶切与转座酶标记技术,精准定位转录因子或组蛋白修饰在基因组中的结合位点,助力研究DNA-蛋白互作机制,为基因组和表观遗传学研究提供精准解...
官方教程地址:CUT&Tag Data Processing and Analysis Tutorial (yezhengstat.github.io) 用到的软件之类的大家自行下载哈。用conda装就行 我看了官方的教程,其中是有部分冗余,且有细微的错误,会报错。 这里简单的将我运行后没问题的代码贴过来。 其实主要的流程包括 1.质控 2.比对到基因组3.callpeak。中间用R...