ChIP-Seq文库构建方法 一、样本要求 1)浓度≥10ng/μL,总量≥200ng,OD260/280为1.8-2.2,若单次ChIp的量不够,建议将2-3次ChIp的DNA合并在一起 2)提供DNA片段大小的凝胶电泳图,要求片段大小不超过400bp 3)样品用1.5mL离心管,用Parafilm封口,冰袋保存...
ChIP-Seq 文库构建的十大策略 1. 始终使用新鲜的试剂和耗材 高质量的文库制备是成功的ChIP-seq实验的关键。文库制备当天准备新鲜试剂非常重要，始终确保酶确保酶储存在适当的温度，确保其稳定性。使用低吸附试管，可显着降低DNA 与塑料制品的表面结合。2. 始终使用荧光计定量DNA 传统的分光光度计不能精确定量低浓度...
使用染色质免疫沉淀,然后测序或ChIP-seq,可以分析全基因组的DNA结合蛋白,组蛋白修饰和核小体。ChIP-seq文库的制备允许研究基因调控和表观遗传机制。 标准DNA文库制备与ChIP-seq文库制备没有什么不同。存在几种商业方法,通常适用于称为Illumina测序的下一代测序平台,其也可用于标准DNA文库制备。其他新一代测序平台包括...
用本试剂盒制备的免疫富集的DNA片段样本可用于ChIP-seq。要构建下游NGS测序用的DNA文库,请使用与您的下游测序平台相容的DNA文库制备实验步骤或试剂盒。 对于Illumina® 平台上测序,我们建议使用Engibody品牌的DNA建库试剂盒Smart-Lib™ DNA library Prep Kit for illumina®,该试剂盒专为酶切法和超声法得到的DNA...
⑤进行文库构建，上机测序。3.ChIP-Seq是所有物种都能做吗？研究对象要求是有参考基因组、拼接至染色体...
以下是ChIP-seq的建库方法: 1.样本准备:首先,需要准备待检测的细胞样本,并将其进行处理,以使蛋白质与DNA分离。 2.染色质免疫沉淀:使用特定的抗体对目标蛋白质进行免疫沉淀,同时将DNA与蛋白质分离。 3.文库构建:将纯化的DNA片段进行末端修复、加尾和连接接头等操作,构建成可用于测序的文库。 4.测序:将构建好的...
ChIP-seq实验原理一览图 操作步骤如下: 一、DNA文库构建 1、DNA片段粘性末端补平修复 2、5'端加磷酸基团及3'端加A 3、加测序用接头Adaptors 4、建库PCR扩增 5、DNA文库PCR产物纯化 用本试剂盒制备的免疫富集的DNA片段样本可用于ChIP-seq。要构建下游NGS测序用的DNA文库,请使用与您的下游测序平台相容的DNA文库...
ChIP-seq实验原理一览图 操作步骤如下: 一、DNA文库构建 1、DNA片段粘性末端补平修复 2、5'端加磷酸基团及3'端加A 3、加测序用接头Adaptors 4、建库PCR扩增 5、DNA文库PCR产物纯化 用本试剂盒制备的免疫富集的DNA片段样本可用于ChIP-seq。要构建下游NGS测序用的DNA文库,请使用与您的下游测序平台相容的DNA文库...
Bioinformatics专题—ChIP-seq 染色体免疫共沉淀(ChIP)是一种用于研究蛋白质与DNA的体内相互作用的经典实验技术。采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀,由此可以把目的蛋白所结合的基因组DNA片段也富集下来。通过与高通量测序技术的结合,对ChIP后的DNA产物进行测序分析,从全基因组...
ChIP-Seq文库构建的十大策略 1.始终使用新鲜的试剂和耗材 高质量的文库制备是成功的ChIP-seq实验的关键。文库制备当天准备新鲜试剂非常重要, 始终确保酶确保酶储存在适当的温度,确保其稳定性。使用低吸附试管,可显着降低DNA 与塑料制品的表面结合。 2.始终使用荧光计定量DNA ...