ChIP-Seq文库构建方法 一、样本要求 1)浓度≥10ng/μL,总量≥200ng,OD260/280为1.8-2.2,若单次ChIp的量不够,建议将2-3次ChIp的DNA合并在一起 2)提供DNA片段大小的凝胶电泳图,要求片段大小不超过400bp 3)样品用1.5mL离心管,用Parafilm封口,冰袋保存 二、流程 ChIP DNA ↓
ChIP-Seq 文库构建的十大策略 1. 始终使用新鲜的试剂和耗材 高质量的文库制备是成功的ChIP-seq实验的关键。文库制备当天准备新鲜试剂非常重要，始终确保酶确保酶储存在适当的温度，确保其稳定性。使用低吸附试管，可显着降低DNA 与塑料制品的表面结合。2. 始终使用荧光计定量DNA 传统的分光光度计不能精确定量低浓度...
染色质免疫共沉淀-高通量测序(ChIP-Seq):是指通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集与目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化和文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序,是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段,为转录因子、组蛋白修饰、核小体定位等表观遗传学的研究提供有效方法。 二、...
1 ChIP-Seq文库构建的十大策略 1.始终使用新鲜的试剂和耗材高质量的文库制备是成功的ChIP-seq实验的关键。文库制备当天准备新鲜试剂非常重要,始终确保酶确保酶储存在适当的温度,确保其稳定性。使用低吸附试管,可显着降低DNA 与塑料制品的表面结合。 2.始终使用荧光计定量DNA 传统的分光光度计不能精确定量低浓度的...
一种单细胞ChIP-seq文库的制备方法.pdf,本发明公开了一种单细胞ChIP‑seq文库的制备方法,涉及表观遗传学领域,添加物包括辅助DNA添加物或者抗原类似物;单细胞ChIP‑seq文库制备方法为将单细胞分选到96孔板中,经过染色质开放处理之后,每个样品孔中加入带有特异序列标
3.文库构建：将纯化的DNA片段进行末端修复、加尾和连接接头等操作，构建成可用于测序的文库。4.测序：将构建好的文库进行测序，获得ChIP-seq数据。5.数据分析：对测序得到的ChIP-seq数据进行质量控制、峰值分析和差异表达基因筛选等分析，以获取实验所需的信息。需要注意的是，ChIP-seq技术需要使用高质量的抗体和优化...
诺禾致源-ChIP-seq 流程 ChIP-seq 染色体免疫共沉淀（ChIP）是一种用于研究蛋白质与DNA的体内相互作用的经典实验技术。采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀，由此可以把目的蛋白所结合的基因组DNA片段也富集下来。通过与高通量测序技术的结合，对ChIP后的DNA产物进行测序分析，从全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合...
因此,在本研究中,我们利用传统中草药穿心莲(Andrographis paniculata)的叶片作为植物材料,建立了一个高效的、简便的ChIP-seq方法,该方法利用常见的组蛋白H3K27me3修饰抗体对穿心莲基因组中的H3K27me3修饰区域进行富集,最后采用Tn5转座酶的DNA文库构建策略,完成ChIP-seq文库的构建。该方法可在2-3天内完成整个文库的...
染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基因的转录、染色质的空间构型和构象密切相关。运...
ChIP-Seq原理 首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DN...