因此,Chip和Chip-seq的主要区别在于Chip-seq结合了高通量测序技术,可以对整个基因组进行分析,而不仅仅是特定DNA序列的富集。这使得Chip-seq成为研究基因调控和染色质修饰的强大工具。
染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效...
ChIP-Seq是揭示特定转录因子或蛋白复合物的结合区域,实际是研究DNA和蛋白质的相互作用,利用抗体将蛋白质...
组蛋白修饰chipseq和转录因子chipseq区别是形状不同。1、组蛋白修饰chipseq是圆形,点状结合和更长的染色质结构域。2、转录因子结合是棱形,它的特征峰,峰型高,而且窄。
ChIP 用来在空间上和时间上不同蛋白沿基因或基因组定位 转录因子和辅因子结合作用 复制因子和 DNA 修复...
exo就是exonucleases,能够从5'至3'方向消化没有和蛋白结合的DNA。我的理解是,这样使得chip-exo捕获的片段更小,peak calling的精度更高,同时计算的motif也能更准确。
1、相同点在基因组水平上鉴定转录因子的结合位点,具有与ChIP-Seq同样的功能,都是通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分...
这也就决定了ATAC-seq与Chip-seq call出来的peak代表的意义不同。 Chip-seq peak是被目的蛋白结合拉下来的DNA,一般只有一个峰,而ATAC-seq是被Tn5转座酶切开、没有被组蛋白结合、染色质开放的DNA位点,如果是TF结合的区域,一般会有一个山谷般的存在。
ATAC-seq技术可以进行样本之间差异的染色质开放位点的比较,通常并不单独使用。作为检测表观遗传-染色质...