因此,Chip和Chip-seq的主要区别在于Chip-seq结合了高通量测序技术,可以对整个基因组进行分析,而不仅仅是特定DNA序列的富集。这使得Chip-seq成为研究基因调控和染色质修饰的强大工具。
染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效...
ChIP-Seq实验原理:示意图为Fig.1和Fig.2.在生理状态下,把细胞内的DNA与蛋白质交联(Crosslink)后裂解细胞,分离染色体,通过超声或酶处理将染色质随机切割,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,再通过反交联(Reverse crosslink)释放结合蛋白的DNA片段,最后测序获...
ChIP指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),seq 指的是二代测序,那么ChIP-seq实际上也就是染色质免疫共沉淀+二代测序的一个过程。ChIP用来确定蛋白质与DNA相互作用情况,所以目前的ChIP-Seq 研究主要包括两大类应用——TF ChIP和Histone ChIP:即转录因子chip和组蛋白的chip 先看转录因子的ChIP-s...
ChIP- SEQ 和 ChIP-on-chip的主要区别是分辨率、覆盖范围和灵敏度(表 1)。从理论上来讲,测序技术需要单核苷酸分辨率,而芯片技术受到覆瓦(tiling)度的限制。已经有将染色质免疫共沉淀技术和 测序结合(ChIP-SEQ)或者与全基因组阵列分析结合(ChIP-on-chip),产生特定蛋白质的基因组结合图谱的研究。如果将以上两种方...
一文读懂 ChIPseq 一、介绍 ChIP-seq,测序方法 ChIP指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP), seq指的是二代测序方法 作用:识别蛋白质与DNA互相作用情况 原理:染色质免疫共沉淀 + 二代测序 应用:常用于转录因子结合位点和组蛋白修饰位点的研究...
染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq): 主要用于蛋白质与DNA相互作用研究,采用特异抗体对目的蛋白进行免疫沉淀,分离与目的蛋白结合的基因组DNA片段,对其进行纯化和文库构建,再通过高通量测序的方法,在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA片段信息。(与外显子测序...
ChIP(Chromatin immunoprecitation)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。 “染色质”就是由“组蛋白和DNA”组成的物质;“免疫”就是通过...