验证转录因子结合位点的功能:通过ChIP-qPCR分析不同转录因子结合位点的富集程度,可以确定这些结合位点在基因调控中的功能重要性。 研究疾病相关基因的调控:ChIP-qPCR可以用于研究疾病相关基因的调控机制,例如确定转录因子与致病突变基因的结合情况,了解其对基因表达的影响。 三、ChIP...
最好用试剂盒,便于后面的PCR检测DNA的鉴定可以进行二代测序或者qPCR检测结果因为ChIP实验涉及的步骤多,结果的重复性较低,所以对ChIP实验过程的每一步都应设计相应的对照,而且对结果的分析也需要有一定的经验。如果ChIP实验方面有什么问题,欢迎与我们交流哦!实验Q&AQ:ChIP-Seq和ChIP-qPCR有何异同?A:染色质免疫共沉淀...
ChIP-seq前期交联,制备细胞核和片段化等流程需要的时间较久,且后续建库需要经历末端修复,接头连接,接头纯化,PCR扩增和文库纯化等步骤,所以整体的实验过程较复杂。CUT&Tag的主要过程在于样本制备较为简单,相较于ChIP-seq抗体孵育的时间也会有所缩短,且转座的过程中已加入测序的接头,后续仅需要经过一次PCR的扩增即可得到...
在 ChIP-PCR 或 ChIP-seq 中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂和下一代测序 (NGS) 技术便能检测和定量免疫富集的 DNA 片段。ChIP 可以用来回答大量涉及蛋白和染色质相互作用的科学问题。例如,ChIP 可用来比较某些蛋白在各位点上的存在情况,绘制某个目的基因组区域内的各种蛋白图,或定量能够在受到刺激一段时间后...
ChIP- SEQ 和 ChIP-on-chip的主要区别是分辨率、覆盖范围和灵敏度(表 1)。从理论上来讲,测序技术需要单核苷酸分辨率,而芯片技术受到覆瓦(tiling)度的限制。已经有将染色质免疫共沉淀技术和 测序结合(ChIP-SEQ)或者与全基因组阵列分析结合(ChIP-on-chip),产生特定蛋白质的基因组结合图谱的研究。如果将以上两种方...
ChIP-chip技术的优点是，可以在体内进行反应；在给定的检验细胞环境的模式下得到DNA相互关系的简单影像；使用特异性修正抗体鉴定与包含有一个特异性后转录修正的蛋白质的相关位点；直接或者间接（通过蛋白质与蛋白质的相互作用）的鉴别基因组与蛋白质的相关位点。缺点是：需要一个特异性蛋白质抗体，有时难于...
解释：一、CHIP-PCR的基本原理 CHIP-PCR技术结合了染色质免疫沉淀和聚合酶链反应的特点。在细胞内，蛋白质与DNA的结合是调控基因表达的关键因素之一。通过CHIP技术，我们可以“捕捉”到与特定蛋白质结合的DNA片段，这些片段很可能是调控基因表达的关键区域。随后，利用PCR技术对这些DNA片段进行扩增...
二.ATAC-seq和ChIP-seq到底有啥区别? Chip-seq是实验前明确有一个感兴趣的转录因子,根据目标转录因子设计抗体去做Chip-seq实验拉DNA,验证感兴趣的转录因子是否与DNA存在相互作用;而ATAC-Seq一般用于不知道特定的转录因子,是在全基因组范围内检测染色质的开放程度,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息,...
常规PCR实验Protocol 根据待分析样品的数量,标记适宜数量的 0.2 mL PCR管。这些样品应当包括1%样品Input输入对照、阴性对照 Normal Mouse/Rabbit IgG样品,和未加入任何DNA模板的空白对照以排除PCR反应中的DNA污染。 向每管中添加2μL相应的DNA样品。 按下文所述的配比配制PCR反应液总管,记住计算时多算两份以弥补分管...
ChIP-seq和ATAC-seq的区别:ATAC-Seq是全基因组范围内检测染色质的开放程度,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息,一般用于不知道特定的转录因子,用此方法与其他方法结合筛查感兴趣的特定调控因子。ChIP-Seq是明确知道感兴趣的转录因子是什么,根据感兴趣的转录因子设计抗体去做ChIP实验拉DNA,验证感兴趣的...