体内研究:ChIP实验在细胞状态下研究蛋白质和目的基因结合状况,减少了体外实验的误差。与体外实验相比,ChIP实验更能反映细胞内真实的蛋白质和DNA相互作用情况。使用ChIP-seq快速确定下游靶标涉及多个关键步骤。广东ChIP-PCR检测 转录因子机制研究是一个复杂的过程,涉及多个步骤和技术。转录因子机制研究建议(一)。确定研究目...
ChIP-chip技术的优点是，可以在体内进行反应；在给定的检验细胞环境的模式下得到DNA相互关系的简单影像；使用特异性修正抗体鉴定与包含有一个特异性后转录修正的蛋白质的相关位点；直接或者间接（通过蛋白质与蛋白质的相互作用）的鉴别基因组与蛋白质的相关位点。缺点是：需要一个特异性蛋白质抗体，有时难于...
这时,如果一定要做阳性对照,还可以采用另一个方案,使用阳性抗体histone H3抗体配合靶基因的特异性引物来做PCR,因为任何靶基因都有组蛋白的结合,所以histone H3抗体免疫沉淀下来的DNA用靶基因引物做PCR也肯定会产生阳性信号。 特别提醒: ChIP-qPCR和普通逆转录-qPCR的引物设计有很大不同。 普通逆转录qPCR引物设计里一...
CHIP-qPCR:用于比较沉淀的模板与阴性和阳性对照信号强度的相对精确的定量PCR方法。成本较低。此外,还有一些由ChIP衍生出来的方法,如RIP(即用ChIP的方法研究细胞内蛋白与RNA相互结合,具体方法和ChIP差不多,只是实验过程中要注意防止RNase,最后分析时需先将RNA逆转录为cDNA)。(回复“qPCR”,可查阅qPCR相关文章) Tip :...
解释：一、CHIP-PCR的基本原理 CHIP-PCR技术结合了染色质免疫沉淀和聚合酶链反应的特点。在细胞内，蛋白质与DNA的结合是调控基因表达的关键因素之一。通过CHIP技术，我们可以“捕捉”到与特定蛋白质结合的DNA片段，这些片段很可能是调控基因表达的关键区域。随后，利用PCR技术对这些DNA片段进行扩增...
DNA 分析有三种关键方法:ChIP (PCR) ,ChIP芯片和 ChIP测序。现在我将详细介绍这些方法。ChIP (PCR) 中,用实时定量PCR 对分离的 DNA进行定量,通常是采用 TaqMan 或 SYBR Green 技术实现扩增,并通过测量荧光的变化来同步定量目标 DNA 分子。ChIP(PCR)可以在多个样品中分析指定区域,与 ChIP芯片或 ChIP测序相比,...
除了做验证实验外,ChIP DNA也可进行测序分析和芯片分析,测序分析对应的方法是染色质免疫共沉淀(ChIP-SEQ);芯片分析对应的方法是ChIP-on-chip。 这两种方法都可以用于分析目的蛋白结合的未知序列。 1、实时定量 PCR 用比较精确的实时定量PCR方法检测沉淀的DNA样品,称为实时定量染色质免疫共沉淀技术(qChIP)。这种方法...
ChIP-chip的研究焦点主要集中在两个关键领域：一是转录因子与DNA的结合研究，二是组蛋白修饰的分析，包括对组蛋白修饰蛋白和染色体重建的理解。这项技术在理解转录因子动力学、染色体结构分布、组蛋白修饰以及基因组与蛋白质互动等方面展现出广泛应用。其优点在于能够在活细胞或组织内进行实时反应，通过特异性...
你也会明白为什么做ChIP的时候最后都会用PCR或是测序(Seq)进行检测,其实都是针对染色质中DNA。 问题2: ChIP实验研究转录因子,调控因子结合的DNA和组蛋白结合的NDA操作上最大的区别是什么? ChIP实验中由于组蛋白在染色质中表达相对较高,表达也较稳定,转录调控因子表达水平很低,往往是瞬时表达。所以组蛋白研究起来更...