以下是ChIP-seq的建库方法: 1.样本准备:首先,需要准备待检测的细胞样本,并将其进行处理,以使蛋白质与DNA分离。 2.染色质免疫沉淀:使用特定的抗体对目标蛋白质进行免疫沉淀,同时将DNA与蛋白质分离。 3.文库构建:将纯化的DNA片段进行末端修复、加尾和连接接头等操作,构建成可用于测序的文库。 4.测序:将构建好的...
在96孔板中加入细胞,经固定,染色后加入一抗与目标蛋白结合,随后加入ChIL探针(由二抗和ChIL DNA组成),探针中的ChIL DNA经Tn5转座酶整合到目标蛋白所在基因组DNA附近,随后T7 RNA 聚合酶经ChIL DNA中的启动子启动转录,以此处基因组DNA为模板合成RNA,经DNase I消化和裂解释放RNA,以纯化的RNA建库测序。 (3)Drop-ChI...
解决办法：Input/IP DNA提取方式采用柱式法进行回收或者建库前将模版DNA使用2XNGS磁珠进行纯化去除杂质干扰...
验证：通过qPCR对ChIP结果进行验证。高通量测序：准备好ChIP后的DNA样品用于ChIP-seq建库，质检及测序。图3 染色质免疫沉淀ChIP-seq/qPCR实验流程。图4 带标签的染色质免疫共沉淀流程图。04ChIP-seq的应用 上面对ChIP-seq的一些基本概念以及实验流程进行了介绍，那么介绍完这个实验之后，这个实验除了本文开头提到的寻找...
MPB | 高效的药用植物穿心莲组蛋白ChIP-seq的建库方法 2023年6月,中国科学院庐山植物园黄铭坤与中国中医科学院中药研究所孙伟团队以共同通讯在Medicinal Plant Biology上发表了题为Establishment of a convenient ChIP-seq protocol for identification of the histone modification regions in the medicinal plant ...
MPB | 高效的药用植物穿心莲组蛋白ChIP-seq的建库方法 2023年6月,中国科学院庐山植物园黄铭坤与中国中医科学院中药研究所孙伟团队以共同通讯在Medicinal Plant Biology上发表了题为Establishmentof a convenient ChIP-seq protocol for identification of the histonemodification regions in the medicinal plant Andrographis...
chipseq建库失败常见原因：样品不纯、样品质量下降、实验操作不当、仪器故障、质控失败等。1、样品不纯：样品的杂质或稀释得过多将对建库的质量产生影响，需要优化样品的准备工作，如进行DNA/RNA的纯化和质量检测，以确保选择的样品合适。2、样品质量下降：样品储存温度、时间或处理方法不当可能导致质量下降...
Multi-CUT&Tag建库试剂盒(Nanobody-Tn5款) 12592ES12/48 12 T/48 T Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina® (96 Index) 12416ES96 96 index Part V 参考文献 [1]. Dan Lu, Liu L, Sun Y, Song J, Yin Q, Zhang G, Qi F, Hu Z, Yang Z, Zhou Z, Hu Y, Zhang L,...
高通量测序:准备好ChIP后的DNA样品用于ChIP-seq建库,质检及测序。 图3 染色质免疫沉淀ChIP-seq/qPCR实验流程。 图4 带标签的染色质免疫共沉淀流程图。 04 ChIP-seq的应用 上面对ChIP-seq的一些基本概念以及实验流程进行了介绍,那么介绍完这个实验之后,这个实验除了本文开头提到的寻找与转录因子结合的启动子之外,还...
微量建库:只需5ng以上免疫沉淀后的DNA,即可展开测序分析; 方案灵活:根据不同的项目需求,选择不同的组蛋白修饰特异性抗体。 技术路线: 参考文献: Ryuichiro Nakato, Toyonori Sakata,Methods for ChIP-seq analysis: A practical workflow and advanced applications,Methods,Volume 187,2021,Pages 44-53,ISSN 1046-...