分子对接确实是没有非极性氢原子的，使用原始蛋白pdb即可。小分子可以自动添加。发自小木虫IOS客户端 ...
我用蛋白与PFOA对接,选择了LYS69,但是出现了下面这个提醒。。。没有选择成功?然后,下一步也无法进行。。求解 至于为什么选择LYS69,是因为这个蛋白质有文献报道和棕榈酸结合位点是LYS69,GLU62 (这个蛋白和一系列的脂肪酸作用都是这两个位点) 没有人做过这个蛋白和PFOA作用。。我不知道它们的结合位点在哪里。。所...
刚接触学习autodock4.0，尝试蛋白质和药物对接，试用出现很多问题请高手指教：1： 如何准备受体和配体...
目前有一个配体化合物的固定基团要和蛋白质受体中的已知位点(该位点为金属离子)通过手动对接的方法将他们以共价键的形式连接起来,作为下一步的准备结构。(ds或者gold都可以的,最好用gold),一定要是两个指定的作用位点(配体化合物小分子的指定基团和蛋白质受体的指定位点(金属离子)) 如下图(PDB文件中的抑制剂配体...
你
老板说让我用DS中的QM/MM的方法先将小分子和蛋白质中的金属酶进行对接，再通过QM/MM的方法对对接好...
如何用DS将石墨烯和蛋白质对接在一起，我想把蛋白质对接在石墨烯表面上，请指教！发自小木虫IOS客户端 ...
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